یکی از جنجالی ترین مباحثی که در سال های اخیر میان کلیسا و نهادهای دولتی و رسانه های گروهی یونان مطرح است، نقش کلیسای این کشور در سال های 1967 الی 1974 همزمان با حکومت دیکتاتوری سرهنگ ها در مسائل داخلی این کشور جنوب اروپا است. اظهارات خریستودولوس اسقف اعظم این کشور که تاکید کرده بود «در آن دوره تاریخی مشغول به مطالعه و تحقیقات مذهبی بوده و هیچ اطلاعی از شکنجه مردم در زندان های رژیم دیکتاتوری نداشته ام.» بر شکاف موجود افزود. موضع گیری ای که نشان می داد وی به عنوان عالی ترین مقام مذهبی این کشور تمایلی به سخن گفتن در زمینه دوران سیاه دیکتاتوری این کشور ندارد. اسقف کنونی این کشور معتقد است: «اشتباه جناح 21 آوریل (کودتاگران)، اعمال افراطی خشونت آمیز آنها بوده است اما اساس این حکومت دارای «روح مسیحیت یونانی» است و اکثریت روحانیون کلیسا با آن موافق بوده اند.»