از سوی دیگر مرکز تحقیقات استراتژیک مجمع تشخیص مصلحت نظام در بیانیه ای ضمن ابراز خوشحالی از آزادی حسین موسویان، از تلاش عده ای برای ایجاد تفرقه در بین مدیران نظام با استفاده از این مساله انتقاد کرد.

مرکز تحقیقات استراتژیک همچنین اعلام کرد: «تاکنون با هدف حمایت از بررسی دقیق و جامع موضوع و رفع سوءتفاهمات ایجادشده و عدم مستمسک قرار دادن این موضوع به عنوان خوراک خبری رسانه ها و سایت ها، سکوت پیشه کرده بود تا در جوی آرام و به دور از تشنج، این موضوع با درایت خاتمه یابد.»

در این بیانیه آمده است: «آزادی حسین موسویان، معاون مرکز تحقیقات استراتژیک که پس از رفع برخی ابهامات انجام شد، موجب خرسندی این مرکز و مدیران دلسوز نظام شد. این آزادی در شرایطی صورت گرفت که تفرقه افکنان و اختلاف آفرینان داخلی و خارجی قصد داشتند در سالی که توسط مقام عظمای ولایت سال «اتحاد ملی و انسجام اسلامی» خوانده شد، بین صفوف سربازان نظام تفرقه ایجاد کنند و منافع شخصی و جناحی خود را بر منافع ملی و مصالح کشور ترجیح داده و این مساله را دستاویزی برای منافع جناحی و حزبی خود قرار دهند.»