قانون مالیات بر ارزش افزوده که طبق قول رئیس جمهورو با ارائه یک لایحه به مجلس قرار است یکسال مهلت برای فراهم کردن مقدمات اجرای آن به دولت داده شود، درمناطق ویژه و آزاد اقتصادی نیز مشکلاتی را برای تولیدکنندگان ایجاد کرده است.عبادالله کامکار، مدیر عامل منطقه ویژه اقتصادی سلفچگان در جریان بازدید خبرنگاران از این منطقه در این زمینه گفت: متاسفانه در قانون مالیات بر ارزش افزوده، هیچ معافیتی برای تولیدات مناطق ویژه و آزاد اقتصادی در نظر گرفته نشده است و علی رغم پیگیریهای متعدد ما، سه بخشنامه به گمرک منطقه ابلاغ و تاکید شده که باید سه درصد مالیات بر ارزش افزوده از تولیدات منطقه دریافت شود که این عوارض هم اکنون دریافت می شود و تولیدکنندگان با احتساب این سه درصد و چهار درصد حقوق ورودی، 7درصد عوارض می پردازند.بر اساس ماده 11 قانون تشکیل و اداره مناطق ویژه و آزاد اقتصادی، کالاهای تولید و یا پردازش شده در این مناطق، هنگام ورود به سایر نقاط کشور به میزان مجموع ارزش افزوده و ارزش مواد اولیه داخلی و قطعات داخلی به کاررفته درآن، تولید داخلی محسوب شده و از پرداخت حقوق ورودی معاف هستند.به گفته کامکار، این ماده قانونی مشوقی برای توسعه فعالیتهای تولیدی در مناطق ویژه و آزاد اقتصادی است اما تفسیر برخی دستگاه های مجری از این ماده قانونی به نحوی است که هیچگونه معافیتی در این زمینه شامل تولیدات این مناطق نمی شود و عملا این مزیت از بین رفته است.منطقه ویژه اقتصادی سلفچگان در محدوده ای به وسعت 2هزار هکتار در 185کیلومتری تهران، واقع شده است.به گفته امیرمحمدی، دبیر کمیسیون ارزش افزوده شورای عالی مناطق آزاد، بررسی سال گذشته این کمیسیون نشان می دهد این منطقه تولیدی ترین منطقه در میان 16منطقه ویژه اقتصادی کشور است.کامکارگفت: برخلاف تصور عده ای که می گویند این مناطق به محلی برای واردات کالاتبدیل شده اند، هم اکنون 117واحد تولیدی، صنعتی و تجاری در این منطقه فعال هستند که سال گذشته در مجموع بیش از 59هزارتن کالابه ارزش 318میلیارد و 383میلیون تومان واردات مواد اولیه و صادرات داشته اند.در شش ماهه امسال نیز حجم کل واردات و صادرات این واحدها حدود 40تن کالابه ارزش حدود 300میلیارد تومان بوده است.وی همچنین به اشتغال بیش از 3250نفر در این منطقه اشاره کرد:کامکار حجم کل سرمایه گذاری بخش خصوصی داخلی در این منطقه را 282میلیارد و 978میلیون تومان و سرمایه گذاری خارجی را 3میلیارد و 350میلیون دلار اعلام کرد.