خلیلی پس از دو ماه دوری از فوتبال تمرینات خود را آغاز کرد. محسن خلیلی که دو ماه پیش هنگام تمرینات تیم ملی دچار پارگی رباط شد اکنون تمرینات خود را زیر نظر مربی بدنسازش شروع کرده و تصمیم گرفته دوباره بازی های درخشانش را از سر بگیرد. او از وضعیت کنونی اش راضی است و در این باره می گوید: «تمرینات خوبی را طبق برنامه ریزی انجام می دهم و مربی بدنساز و معالجم از شرایط فعلی ام راضی هستند، به همین دلیل در تمرینات هوازی و دویدن های فشار بیشتری به من می آورند.» خلیلی که معالجاتش را در آلمان و البته به خرج خودش انجام داده بود، حالااز مسوولان فدراسیون فوتبال به خاطر عدم همکاری و اقدام برای درمانش دلگیر است: «تمام مخارج در آلمان بر عهده خودم بود و هزینه ها بسیار بالاست. عدم اقدام مسوولان فدراسیون برای پرداخت هزینه های درمانم برایم جای سوال دارد.» خلیلی برخلاف دلخوری از مسوولان فدراسیون از باشگاه پرسپولیس، افشین پیروانی و مهدی واعظی به خاطر دلجویی های شان تشکر کرد: «پس از مصاحبه یی که انجام دادم و ناراحتی خود را اعلام کردم افشین پیروانی و مهدی واعظی با من تماس گرفتند و دلجویی کردند که برایم بسیار ارزش دارد و من از آنها متشکرم.» از آنجایی که خلیلی تمام هزینه های درمانش را خودش تقبل کرده اکنون دچار مشکلات مالی شده که در تماسش با مسوولان باشگاه پرسپولیس خواستار روشن شدن وضعیت مالی اش شده: «از باشگاه پرسپولیس خواستم تکلیف مرا در خصوص طلبی که از باشگاه از فصل گذشته داشتم و قول پرداخت آن را از ابتدای فصل به من داده بودند، روشن کنند. آنها نیز قرار است با توجه به تصویب هیات مدیره، این مبلغ را به من پرداخت کنند چون دچار مشکلات مالی شده ام.» او در خصوص اقدامات فدراسیون برای پرداخت مبالغ خرج شده برای درمانش گفت: «در حال حاضر سرپرست تیم ملی قول هایی را به من داده که امیدوارم عملی شود چون دچار مشکلاتی شده ام.»