دفتر مطالعات و برنامه ریزی رسانه ها مجددا در ساختار سازمانی معاونت امور مطبوعاتی و اطلاع رسانی وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی جای گرفت. روابط عمومی معاونت مطبوعاتی در توضیح این موضوع آورده است:

«در دولت دهم، تصمیمی با پیشنهاد وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی و حمایت و تایید معاونت توسعه مدیریت و سرمایه نیروی انسانی رییس جمهور وقت مبنی بر جدا شدن دفتر مطالعات و برنامه ریزی رسانه ها از معاونت مطبوعاتی و ادغام آن با سایر دفاتر مشابه در معاونت های فرهنگی، هنری و... گرفته شد که علاوه بر اینکه معاون مطبوعاتی پیشین از این تصمیم استقبال نکرده و به دفاع از عدم انتقال این دفتر نیز پرداخت، اساتید، روزنامه نگاران و صاحبنظران حوزه رسانه و مطبوعات هم به اتفاق و در اشکال مختلف نارضایتی خود را از این تصمیم اعلام کردند. حتی مدیران، کارشناسان و کارکنان دفتر مطالعات و برنامه ریزی رسانه ها انتقادی جدی به این جابه جایی داشتند که این انتقادات ریشه در آن داشت که این مجموعه طی سالیان متمادی با حمایت و نگاه تخصصی معاونت مطبوعاتی و سایر ادارات کل آن به صورت حرفه یی به آموزش، تقویت و ارتقای سطح دانش و تخصص روزنامه نگاران و دست اندرکار رسانه و کادرسازی در این بخش پرداخته و از سویی اساتید علوم ارتباطات، روزنامه نگاری در سراسر کشور با تعلق خاص و بدون توقع با این مجموعه همکاری کرده اند و در صورتی که با سایر دفاتر مطالعاتی وزارتخانه در یک ساختار ناهمگون قرار می گرفت انگیزه و سطح تخصصی خدمات کاهش می یافت. این موضوع تا آنجا پیش رفت که دامنگیر وزارت ارشاد در دولت یازدهم نیز شد و از آنجا که تصمیمات در دولت جدید بر مبنای اصول مدیریت سازمانی و با اجماع و توجه به نظرات کارشناسان و خبرگان فن گرفته می شود و با اشاره به پیگیری معاون مطبوعاتی و اطلاع رسانی در طول یک سال گذشته در دولت و وزارت ارشاد و با همراهی و دقت نظر وزیر محترم فرهنگ و ارشاد اسلامی و سایر معاونان و مسوولان وزارتخانه در تاریخ 24 شهریورماه 93 دفتر مطالعات و برنامه ریزی رسانه ها مجددا در ساختار معاونت مطبوعاتی جای گرفت. این اتفاق می تواند نویدبخش ادامه خدمات تخصصی و حرفه یی دفتر در حوزه رسانه ها باشد و امید است با تعامل سازنده شاهد بهره مندی و استفاده بهینه از تمامی ظرفیت این مجموعه باشیم.»