جزیره قبر ناخدا در شمال جزایر بونه و دارا و در دهانه خورموسی در محدوده شهرستان بندر ماهشهر قرار دارد. مساحت این جزیره غیرمسکون 2/4 هکتار است که البته به هنگام جزر و با پیوستن پشته های شنی وسیع بیرون آمده از آب، مساحت آن تا چندین صد هکتار افزایش پیدا می کند. جزیره قبر ناخدا که به قمر هم معروف است با وجود پوشش گیاهی بسیار خوب بخش مرکزی فاقد آب شیرین بوده و قابل سکونت نیست. این جزیره که دفن دختر یک ناخدای قدیمی دلیل انتخاب این نام برای آن است، در دوران هخامنشیان چسبیده به خاک اصلی بوده و بنا به گفته های غیررسمی، زیر خاک آن تاسیسات بندری و مرکز کشتی سازی این دوران قرار دارد. پرستوی دریایی گونه سفید، کاکائی، آبچلیک، اگرت ساحلی، اگرت بزرگ و سلیم خرچنگ خوار از جمله پرندگان این جزیره هستند که با قایق موتوری حدود یک و نیم ساعت با بندر ماهشهر فاصله دارد.البته جانورانی چون موش سیاه، سوسمار، مارمولک و لاک پشت نیز در این جزیره زیبا زندگی می کنند..