دستگاه تناسلی مبهم در جنینی که از نظر ژنتیک دختر است به دلایل مختلفی اتفاق می افتد. مثلا پرکاری مادرزادی غده فوق کلیه که در آن مقادیر زیادی هورمون مردانه تولید و باعث دستگاه تناسلی مبهم در نوزاد دختر می شود. حتی قرار گرفتن نوزاد در معرض هورمون های مردانه در داخل رحم از دیگر عوامل است. بعضی داروها سبب تولید هورمون های مردانه در بدن می شوند یا این که خودشان خاصیت هورمون مردانه دارند.

اگر این داروها در دوران حاملگی توسط مادر مصرف شوند خطر تولد نوزاد دختر با دستگاه تناسلی مبهم وجود دارد. به عنوان مثال می توان از پروژسترون نام برد که اکثرا توسط خانم ها اوایل حاملگی برای پریود شدن تزریق می شود.