سیدجواد طباطبایی یکی از بحث برانگیزترین کارشناسان علوم سیاسی و تاریخ ایران است که نقدهای ریشه ای و جدی بسیاری بر آرای او وارد شده است. اگرچه تقریبا تمام روشنفکران و متفکران مستقل ایران از طیف های مختلف، از حمید عنایت، علی شریعتی و هما کاتوزیان تا حسین بشیریه و مراد فرهادپور و دیگران، از جایگاه رسمی طباطبایی در ساختار قدرت به نقد کشیده شده اند، منتقدان او نیز بیکار نبوده اند و تحلیل ها و تفاسیر او را نقد و بررسی کرده اند. یکی از جدیدترین موارد، نقد حسن قاضی مرادی است که در آخرین کتابش «تاملات ابزاری» به همت نشر اختران منتشر کرده است. او در این کتاب به نقد برخی آرای طباطبایی در حوزه اندیشه سیاسی