در اولین روز از فروردین سال 1346 خداوند به حجت الاسلام محمد آقا نجفی فرزندی عطا کرد و او را شمس الدین نام نهادند که پس از گذر 6 سال از داشتن محبت پدری محروم گشت.

وی در حین تحصیل در دوره نظری بود که جنگ تحمیلی آغاز شد، شمس الدین که جوانی رشید و غیرتمند بود، نتوانست در برابر تجاوزکاران بعثی بی تفاوتی و سکوت اختیار کند، لذا چون رزمندگان اسلام راه مقابله با تجاوزکاران را پیش گرفت و سرانجام در عملیات ظفرمند کربلای 5 در تاریخ 5 اسفند ماه سال 65 به فیض شهادت نائل آمد و اجر مجاهدت های فراموش ناشدنی خود را دریافت کرد.

قسمتی از وصیت نامه شهید شمس الدین آقانجفی:

من مرگ سرخ را به زندگی ذلت بار ترجیح می دهم. به جبهه جنگ آمدم. تا با ضد خدا در راه جهاد سازندگی به جنگ بپردازم.

من قدم نهادن در راه خدا را، وظیفه شرعی می دانم، در این راه اگر دشمن را شکست دهیم، پیروزیم؛ اگر به ظاهر شکست بخوریم و کشته شویم، باز هم پیروزیم.