برای درمان عفونت گوش در نوزادان در بسیاری از موارد، نیازی به مصرف آنتی بیوتیک نیست و با درمان های خانگی از قبیل مصرف استامینوفن، نوشیدن مایعات و کمپرس گرم قابل درمان است. پزشکان تاکید می کنند: درمان عفونت گوش در نوزادان به نوع و شدت آن بستگی دارد، اما در بسیاری از موارد سیستم ایمنی نوزاد قادر به مقابله با این عفونت است. مصرف آنتی بیوتیک ها با عوارض جانبی همراه است. حدود 15 درصد کودکان دچار اسهال و استفراغ می شوند و در بیش از 5 درصد کودکان مصرف آنتی بیوتیک ها با واکنش های حساسیت زا همراه است.