فهرست مطالب

دانشکده پزشکی اصفهان - پیاپی 426 (هفته دوم خرداد 1396)

مجله دانشکده پزشکی اصفهان
پیاپی 426 (هفته دوم خرداد 1396)

  • تاریخ انتشار: 1396/03/10
  • تعداد عناوین: 5
|
  • مقاله پژوهشی
  • طبقه بندی و آنالیز شباهتی پایگاه مولکولی Binding-DB: بررسی کاربرد مدل های طبقه بندی چند منظوره برای استخراج قوانین تجمعی عمومی از پایگاه های بزرگ مولکولی
    مرضیه مختاری، احمد مانی ورنوسفادرانی صفحات 400-405
    مقدمه
    در این مطالعه، با استفاده از ترکیبی از روش های کاهش بعد داده و طبقه بندی، ویژگی های مواد دارویی مورد بررسی قرار گرفت. تعریف و آماده سازی مولکول های «غیر فعال» برای توسعه ی مدل های تفکیکی دوتایی (Two-class classifier) یکی از مشکلات عمده در مسیر استفاده از مدل های تفکیکی بر پایه ی لیگاند در روند طراحی سیستماتیک دارو می باشد. از این رو، با استفاده از مولکول های «فعال» موجود در پایگاه Binding-DB، به توسعه ی مدل های تفکیکی چند متغیره ی چند منظوره پرداخته شد.
    روش ها
    به این منظور، در حدود 160372 ریز مولکول برای 45 هدف دارویی مختلف از پایگاه مولکولی Binding-DB دانلود شد و پس از بهینه سازی ساختار، 1497 ویژگی فیزیکی و شیمیایی برای هر مولکول استخراج گردید. با استفاده از الگوریتم Apriori و ترکیب آن با روش طبقه بندی تفکیکی خطی (Linear discriminant analysis)، ویژگی های مولکولی برای هر هدف دارویی به منظور تفکیک مولکول های فعال استخراج شد.
    یافته ها
    در نهایت، با استفاده از غربالگری مجازی در پایگاه داده های مولکولی Zinc و Binding-DB و محاسبه ی سطح زیر نمودار Receiver operating characteristic (ROC) صحت و حساسیت طبقه بندی مورد بررسی قرار گرفت. میزان سطح زیر نمودار ROC برای هر بهینه سازی پایگاه Zinc به طور میانگین برابر با 1495/0 ± 8341/0 و در پایگاه Binding-DB به طور میانگین برابر با 1502/0 ± 8615/0 بود.
    نتیجه گیری
    می توان با استفاده از الگوریتم ارایه شده، ویژگی هایی برای هر دسته از ریز مولکول های مرتبط با هر هدف دارویی استخراج کرد و پایگاه های مولکولی مختلف را برای هر هدف دارویی بهینه سازی کرد. سطح زیر نمودار ROC برای دو پایگاه مولکولی مورد بررسی نشان می دهد که روش ارایه شده، روش مفیدی برای طبقه بندی پایگاه های بزرگ مولکولی بدون استفاده از ریز مولکول های غیر فعال می باشد.
    کلیدواژگان: غربالگری مجازی، طبقه بندی چند منظوره، بررسی داده، طبقه بندی پایگاه داده، لیگاند
    چکیده مشاهده متن زبان: فارسی
  • بررسی عملکرد تیم احیای بیمارستان شهید چمران اصفهان در سال 1394
    مجتبی منصوری، غلامرضا معصومی، سیدعلی امامی، فرهاد محمودی، امیر رضا شکرانی صفحات 406-411
    مقدمه
    یکی از مهم ترین اقدامات جهت نجات جان بیماران دچار Arrest قلبی، انجام عملیات احیا می باشد. این مطالعه، با هدف بررسی عملکرد تیم احیای بیمارستان چمران اصفهان انجام شد.
    روش ها
    این مطالعه ی مقطعی، شامل 211 نفر از بیمارانی بود که در سال 1394 در بیمارستان یا خارج از آن دچار Arrest قلبی- تنفسی شده بودند و برای آن ها، احیای قلبی- ریوی (Cardiopulmonary resuscitation یا CPR) شروع شده بود. اطلاعات احیای بیماران از روی چک لیست از پیش تهیه شده، تکمیل گردید.
    یافته ها
    در این مطالعه، 211 نفر بیمار شامل 140 نفر (35/66 درصد) مرد و 71 نفر (65/33 درصد) زن مورد بررسی قرار گرفتند. شاخص های دموگرافیک اعم از جنس، سن بیماران و محل شروع احیا (داخل و یا خارج بیمارستان) در موفقیت اولیه و بقای یک ماهه تاثیر نداشت (050/0 < P برای همه)، اما نیاز به احیای پیشرفته، فاصله ی زمانی بین Arrest تا شروع احیای پیشرفته، نیاز به شوک (در ریتم های قابل شوک)، فاصله ی زمانی Arrest تا اولین شوک، طول مدت CPR و انطباق احیای پایه و پیشرفته با الگوریتم American Heart Association (AHA) در موفقیت اولیه ی احیا تاثیر معنی داری داشت (050/0 > P برای همه)، اما در مورد بقای یک ماهه فقط فاصله ی زمانی Arrest تا اولین شوک تاثیر معنی داری داشت (010/0 = P).
    نتیجه گیری
    در این مطالعه، تاثیر شاخص های دموگرافیک بر نتایج حاصل معنی دار نبود، اما نیاز به احیای پایه، پیشرفته و دریافت شوک در ریتم های قابل شوک و همچنین، فاصله تا انجام اولین شوک، تاثیر معنی داری بر موفقیت اولیه ی حاصل از احیا داشته است. عدم تطابق احیا در درصدی از موارد با راهنمای AHA، ضرورت بازآموزی منظم و مدون را گوشزد می کند.
    کلیدواژگان: احیای پایه، احیای پیشرفته، Arrest قلبی- تنفسی، احیای قلبی - ریوی
    چکیده مشاهده متن زبان: فارسی
  • بررسی تاثیر مصاحبه ی انگیزشی و رژیم غذایی سالم بر شاخص های انتروپومتریک و فشار خون کودکان دبستانی مبتلا به اضافه وزن و چاقی
    فاطمه شهریارزاده، رویا کلیشادی، مریم فاتحی زاده، اکبر حسن زاده، غلامرضا عسکری صفحات 412-421
    مقدمه
    شیوع چاقی کودکان در جهان رو به افزایش است. رژیم غذایی سالم، از جمله مداخلات مورد استفاده در درمان چاقی می باشد. روش های رفتاردرمانی می توانند بر رفتارهای غذایی کودکان موثر باشند. یکی از زیر شاخه های رفتاردرمانی، مصاحبه ی انگیزشی می باشد.
    روش ها
    مطالعه ی حاضر، یک کارآزمایی بالینی تصادفی شده ی موازی بود. 96 کودک به طور تصادفی در سه گروه قرار گرفتند. گروه اول، رژیم درمانی و مصاحبه ی انگیزشی، گروه دوم رژیم درمانی و گروه سوم، گروه شاهد بودند. شرکت کنندگان 8 هفته تحت مداخله قرار گرفتند. شاخص های انتروپومتریک و فشار خون در ابتدا و انتهای مداخله سنجیده شد. جهت اطمینان از پایدار ماندن اثرات مداخله، افراد 3 ماه بعد بار دیگر مورد ارزیابی قرار گرفتند. میزان پای بندی به رژیم با محاسبه ی شاخص تغذیه ی سالم سنجیده شد.
    یافته ها
    میانگین نمایه ی توده ی بدنی و دور کمر در گروه رژیم درمانی و مصاحبه ی انگیزشی (001/0 > P) و در گروه رژیم درمانی (001/0 = P) بعد از مداخله، کاهش یافت، اما در گروه شاهد این اختلاف معنی دار نبود. این کاهش در گروه رژیم و مصاحبه ی انگیزشی نسبت به گروه رژیم بیشتر بود. بین میانگین فشار خون در سه زمان در هر سه گروه، اختلاف معنی داری مشاهده نشد. میانگین شاخص تغذیه ی سالم در گروه رژیم و مصاحبه ی انگیزشی نسبت به گروه رژیم بالاتر بود. بین شاخص تغذیه ی سالم با تغییرات نمایه ی توده ی بدنی و دور کمر، رابطه ی معکوسی وجود داشت (001/0 = P).
    نتیجه گیری
    رژیم غذایی سالم، منجر به کاهش نمایه ی توده ی بدنی و دور کمر کودکان چاق یا دچار اضافه وزن می گردد. همراه کردن رژیم درمانی با مصاحبه ی انگیزشی، تاثیر رژیم و میزان پای بندی کودکان به آن را افزایش می دهد.
    کلیدواژگان: مصاحبه ی انگیزشی، رژیم غذایی سالم، انتروپومتری، فشار خون، اضافه وزن
    چکیده مشاهده متن زبان: فارسی
  • تعیین جهش ژن های gyrA و parC در جدایه های Pseudomonas Aeruginosa مقاوم به سیپروفلوکساسین در نمونه های زخم سوختگی در یزد
    سحر سادات عمادی، احمد مصدق، محمود وکیلی، مجید ابراهیم زاده، گلنار ایزدی، اکرم استانی صفحات 422-427
    مقدمه
    Pseudomonas aeruginosa یکی از مهم ترین عوامل عفونت های بیمارستانی به ویژه در بخش سوختگی با درصد مقاومت بالا در برابر دارو می باشد. یکی از مکانیسم های مقاومت در این باکتری، جهش های کروموزومی در ناحیه ی Quinolone-resistance-determining region (QRDR) ژن های کروموزومی می باشد. هدف از انجام این مطالعه، بررسی جهش ژن های gyrA و parC در جدایه های Pseudomonas aeruginosa مقاوم به سیپروفلوکساسین در نمونه های زخم سوختگی بود.
    روش ها
    تعداد 50 جدایه ی بالینی Pseudomonas aeruginosa جدا شده از بیماران بستری در بخش سوختگی بیمارستان سوانح سوختگی شهید صدوقی یزد تعیین هویت گردید. جهت تعیین حداقل غلظت مهار کنندگی (Minimum inhibitory concentration یا MIC) سیپروفلوکساسین از روش E-test و برای بررسی جهش در ژن های gyrA و parC در جدایه های مقاوم به سیپروفلوکساسین، از روش Polymerase chain reaction-sequencing (PCR-sequencing) استفاده شد.
    یافته ها
    62 درصد نمونه ها نسبت به آنتی بیوتیک سیپروفلوکساسین مقاوم بودند. جهش در gyrA در تمامی نمونه ها (100 درصد) و جهش در parC در 41 جدایه (82 درصد) از 50 جدایه دیده شد. فراوان ترین جهش در ژن gyrA تبدیل T83I و در ژن parC تبدیل S87L بود. هیچ گونه جهشی در جدایه های حساس یافت نشد.
    نتیجه گیری
    جهش در منطقه ی تعیین شده ی مقاومت کینولونی، یکی از مهم ترین مکانسیم های مقاومت به فلوروکینولون در جدایه های بالینی Pseudomonas aeruginosa می باشد. با توجه به شیوع این ژن ها، این جهش ها نقش مهم و اساسی را در ایجاد مقاومت ایفا می کنند.
    کلیدواژگان: Pseudomonas aeruginosa، زخم، سوختگی، فلوروکینولون ها
    چکیده مشاهده متن زبان: فارسی
  • بررسی اثر آگاهی بخشی به بیماران، پیش از عمل جراحی Percutaneous Nephrolithotomy (PCNL) بر شدت درد و اضطراب بعد از عمل جراحی
    مهرداد محمدی، سیدعلی امامی، فرهاد محمودی، سعیده بحرانی صفحات 428-433
    مقدمه
    یکی از بیماری های شایع در حیطه ی اورولوژی، سنگ های کلیه و مجاری ادراری است. بیماران پس از اعمال سنگ شکنی، دچار درد شدید پس از عمل می شوند که شاید یکی از علل آن، ناآگاهی از سیر درمان است. با توجه به اهمیت و کاربرد فراوان روش Percutaneous nephrolithotomy (PCNL) در درمان سنگ کلیه، مطالعه ی حاضر با هدف بررسی اثر آگاهی بخشی قبل از عمل بر شدت درد و اضطراب بیمار بعد از عمل انجام شد.
    روش ها
    مطالعه ی حاضر از نوع کارآزمایی بالینی بود. شرکت کنندگان شامل 130 بیمار بودند که در Spiral computed tomography scan (Spiral CT scan)، وجود سنگ کلیه ی آن ها تایید شد. این افراد، به صورت تصادفی در دو گروه مورد و شاهد تقسیم شدند و اثر آموزش پیش از عمل بر درد و اضطراب بعد از عمل با استفاده از پرسش نامه های Visual analog scale (VAS) وBeck Anxiety Inventory (BAI) بررسی و با به کارگیری آزمون t مستقل، تجزیه و تحلیل شد.
    یافته ها
    130 بیمار شامل 65 خانم و 65 آقا وارد مطالعه شدند. میانگین نمره ی اضطراب در گروه شاهد 84/4 ± 89/34 و در گروه مورد 37/2 ± 98/22 بود (050/0 > P). همچنین، میانگین شدت درد در گروه شاهد 74/26 ± 44/74 و در گروه مورد 17/8 ± 18/34 بود (050/0 > P).
    نتیجه گیری
    در مطالعه ی ما، میانگین شدت درد و اضطراب پس از عمل PCNL در بیمارانی که تحت آموزش قبل از عمل قرارگرفته اند، کاهش معنی داری را نشان می دهد. با توجه به هزینه های اندک آموزش بیماران پیش از عمل و تاثیرات بالقوه ی آن بر درد و اضطراب پس از عمل، این آموزش ها می تواند از نظر اقتصادی و همچنین، شرایط روحی بیمار تاثیر بالقوه ای داشته باشد.
    کلیدواژگان: سنگ کلیه، Percutaneous nephrolithotomy، مراقبت قبل از عمل جراحی
    چکیده مشاهده متن زبان: فارسی
|
  • Classification and Similarity Analysis of Binding-Database: A Survey on Application of Multi-Class Classifiers for Deriving General Rules from Large Compound Databases
    Marzieh Mokhtari, Ahmad Mani-Varnosfaderani Pages 400-405
    Background
    In this research, we extracted and modified features of active ligands related to specific biological targets with combination of data mining and classification methods to aid medicinal chemists in their drug discovery projects. Preparing an inactive ligand is the major problem for development of multi-class classifiers. Therefore, our models were developed based on only active ligands found in Binding-database (DB) without any needs for preparing inactive molecules.
    Methods
    Our database consisted of 160372 ligands in 45 classes of common proteins and 1497 different features (topological, chemistry, physical, etc.) were calculated for each molecule. Then, the specific features of active ligands of any target were extracted based on combination of linear discriminate analysis and Apriori algorithm.
    Findings: Receiver operating characteristic (ROC) was a useful operator to analysis the accuracy and sensitivity of classification models and retrieving molecules from ZINC and Binding-DB databases. Area under curve (AUC) of this diagram was evaluated for analysis of each target in Zinc and Binding-DB and their results were 0.8341 ± 0.1495 and 0.8615 ± 0.1502, respectively.
    Conclusion
    Specific features of active ligands could be found using the methodology described in this work and with these features, we can sort each database based on corresponding target. AUC shows that the present method is useful for virtual screening in big databases without survey on inactive ligands.
    Keywords: Virtual systems, Multiple classification, Data mining, Database management systems, Ligands
    Abstract View Paper Original: Persian
  • Evaluation of the Performance of Cardiopulmonary Resuscitation (CPR) Team, Shahid Chamran Hospital, Isfahan, Iran, in 2015
    Mojtaba Mansouri, Gholamreza Masoumi, Sayed Ali Emami, Farhad Mahmoudi, Amirreza Shokrani Pages 406-411
    Background
    One of the most important issues in order to save life in patients with cardiac arrest is cardiopulmonary resuscitation (CPR). This study evaluated the performance of resuscitation team in Chamran hospital, Isfahan, Iran, in 2015.
    Methods
    This cross-sectional study included 211 patients undergone CPR, in or out of the Chamran hospital. The CPR process data were collected from patient's files and the CPR heads filled out the checklists.
    Findings: The patients were 140 men (66.35%) and 71 women (33.65%). The age, sex, and location of CPR had not significant effect on the outcome of CPR (P > 0.050 for all). Use of advanced life support, the time between cardiac arrest and start of advanced life support, the time between cardiac arrest and applying first shock, use of electroshock, CPR due to basic life support (BLS), CPR due to advanced life support (ALS), and duration of CPR had significant effect in primary survey of CPR (P
    Conclusion
    In our study, demographic indices did not have significant effect on primary CPR outcome but need to basic and advanced life supports, applying shock to shockable rhythm and also the time between cardiac arrest and applying first shock had significant effect on primary successful CPR. Incompatibility in the percentage of CPR cases with American Heart Association (AHA) guideline notes the necessity of regular and continuous retraining.
    Keywords: Advanced cardiac life support, Basic cardiac life support, Cardiopulmonary resuscitation (CPR)
    Abstract View Paper Original: Persian
  • The Effect of Motivational Interviewing and Healthy Diet on Anthropometric Indices and Blood Pressure in Overweight and Obese School Children
    Fatemeh Shahriarzadeh, Roya Kelishadi, Maryam Fatehizadeh, Akbar Hassanzadeh, Gholamreza Askari Pages 412-421
    Background
    The prevalence of children obesity is increasing all over the world. Healthy diet is one of the interventions for obesity treatment. Behavioral therapy approaches can affect child’s food behaviors. One of these approaches is motivational interviewing.
    Methods
    This study was a paralleled randomized clinical trial. 96 children were randomly allocated to 3 groups: first group, diet and motivational interview, second group, diet, and the third one, control. Participants were under intervention for 8 weeks. Anthropometric indecies and blood pressure were measured at baseline and at the end of the intervention. To make sure about the maintenance of intervention effects, participates were assessed 3 month later again. Adherence to diet was assessed by measuring healthy eating index.
    Findings: The mean body mass index (BMI) and waist circumference (WC) in first (P
    Conclusion
    Healthy diet can reduce mean body mass index and waist circumference in overweight and obese children. Using diet therapy with motivational interview increases this effect and also the adherence to diet.
    Keywords: Motivational interviewing, Healthy diet, Anthropometry, Blood pressure, Overweight
    Abstract View Paper Original: Persian
  • Mutations of gyrA and parC Genes in Ciprofloxacin-Resistance Isolates of Pseudomonas Aeruginosa from Burn Wounds in Yazd City, Iran
    Sahar Sadat Emadi, Ahmad Mosadegh, Mahmoud Vakili, Majid Ebrahimzadeh, Golnar Izadi, Akram Astani Pages 422-427
    Background
    Pseudomonas aeruginosa is one of the most important factors for nosocomial infections with percentage of resistance to the drug, particularly in the burn wounds. One of the mechanisms of resistance in these bacteria is chromosomal mutation in the quinolone-resistance-determining region (QRDR) of chromosome gene. The aim of this study was to evaluate gyrA and parC gene mutation in Pseudomonas aeruginosa isolates from burn wound infections resistant to ciprofloxacin.
    Methods
    50 clinical Pseudomonas aeruginosa isolates were identified from patients admitted to burn hospital. Minimum inhibitory concentrations (MICs) of ciprofloxacin were evaluated by E-test method and polymerase chain reaction-sequencing (PCR-sequencing) method was carried out to assess the gyrA and parC mutations in ciprofloxacin-resistant isolates.
    Findings: From 50 isolates, 62% were resistant to ciprofloxacin. Mutations were detected in all (100%) and 41 isolates (82%) in gyrA and parC genes, respectively. The most frequent mutations were observed in gyrA gene conversion (T83I) and parC (S87L). No mutation was found in sensitive isolates.
    Conclusion
    Results indicate that mutations in the quinolone-resistance-determining-region are the major mechanisms for ciprofloxacin resistance in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. Considering the prevalence of these genes, these mutations play a major role in the development of resistance.
    Keywords: Pseudomonas aeruginosa, Burns, Wounds, Fluoroquinolones
    Abstract View Paper Original: Persian
  • The Effect of Preoperative Education on Postoperative Pain and Anxiety in Patients Undergoing Percutaneous Nephrolithotomy (PCNL)
    Mehrdad Mohammadi, Sayed Ali Emami, Farhad Mahmoudi, Saeideh Bahrani Pages 428-433
    Background
    One of the most common urologic diseases is renal and urinary tract stone. Patients experience severe pain after lithotripsy operation; one cause maybe the limited knowledge about the procedures. Due to important and considerable application of percutaneous nephrolithotomy (PCNL) procedure, we decided to evaluate the effect of preoperative education on postoperative pain and anxiety in these patients.
    Methods
    This clinical trial study included 130 patients who underwent the percutaneous nephrolithotomy. Nephrolithiasis was confirmed via spiral computed tomography (CT) scan in them. Patients divided randomly into two groups. This study followed with two parallel groups of equal size, and the effect of preoperative education on postoperative pain and anxiety evaluated by means of visual analog scale (VAS) and Beck Anxiety Inventory (BAI), respectively. Postoperative anxiety and pain intensity were compared using independent t test.
    Findings: The mean anxiety level was 34.89 ± 4.84 and 22.98 ± 2.37 in control and case groups, respectively (P
    Conclusion
    In our study, postoperative stress and pain intensity after percutaneous nephrolithotomy were significantly less in experimental group. Due to less costs of preoperative educations and potential physiological and psychological effects, it is acceptable for patients to get information before surgery.
    Keywords: Kidney stones, Percutaneous nephrolithotomy (PCNL), Preoperative care
    Abstract View Paper Original: Persian