سازمان بازیافت، شهرداری و مجلس شورای اسلامی عقیده دارند که وزارت بهداشت در جمع آوری صحیح زباله های بیمارستانی کوتاهی می کند امحای زباله های بیمارستانی در تهران همچنان به بدترین وضع ممکن و بدون در نظر گرفتن اصول بهداشتی و زیست محیطی انجام می شود.

مرکز سلامت محیط و کار این وزارتخانه هم با این موضوع موافق است که براساس قانون مدیریت پسماندها، تعیین ضوابط اجرایی دفع زباله های بیمارستانی بر عهده وزارت بهداشت و همچنین سازمان محیط زیست است و به همین دلیل آنها اجازه نمی دهند برای دفع زباله بیمارستانی از دستگاه زباله سوز استفاده کرد که باعث آلودگی هوا می شود.