مسجد حکیم در انتهای بازار رنگرزان نزدیک بازارچه نو اصفهان در قرن یازدهم هجری توسط طبیب مخصوص شاه عباس دوم به نام حکیم محمد داوود در محل ویرانه های مسجد جودجیر یا مسجد صاحب اسماعیل بن عباد بنا شد. مسجد جودجیر در شمال غربی این مسجد قرار دارد. مسجد حکیم دارای چهار در خروجی است. مقبره معروف به سادات در گوشه شمال غربی قرار گرفته و چندین آرامگاه دیگر در مقابل در شرقی مسجد وجود دارند که همگی از رجال و دانشمندان و فقهای معروف شهر اصفهان هستند. بر کتیبه سردر شرقی مسجد به خط نستعلیق سفید بر زمینه کاشی لاجوردی اشعاری نوشته شده که تاریخ آن 1067 تاریخ شروع بنا است. کتیبه تاریخی سردر شمالی به خط ثلث سفید بر زمینه کاشی لاجوردی به خط خوشنویس نامدار عصر صفوی تاریخ اتمام بنا را سال 1073 ه.ق بیان می کند. لوحی کوچک با خط نستعلیق سفید بر زمینه لاجوردی نیز نام سازنده بنا را استاد علی بیگ بنای اصفهانی معرفی می کند.