مقام معظم رهبری در دیدار با نمایندگان مجلس نهم به موضوع استقلال مجلس اشاره فرمودند با این بیان که: در همه دولت های گذشته و همه دوره های مجلس این تذکر داده شده است که نباید به اسم استقلال مجلس، درباره هر مسئله ای به دولت معترض شد. مجلس اگر نظر مخالفی دارد می تواند با پرهیز از این گونه برخوردهای غیر مفید در آن زمینه قانون بگذارد.اثربخش بودن و کارآمدی هر نظامی، بدون تردید مدیون یکپارچگی، انسجام، وحدت نظری و کارکرد ارکان آن می باشد. نظام هایی که در درون دچار تعارض شده و در ساختارهای آ ن شاهد هم افزایی نباشیم، حرکت های تعالی بخش در آنها افول نموده و به حرکت های میرا مبدل می شود و نهایتا در وضع موجودشان