علی اکبر ولایتی رسما سکاندار مرکز تحقیقات استراتژیک شد. آیت الله هاشمی رفسنجانی در حکمی علی اکبر ولایتی را به عنوان رئیس مرکز تحقیقات استراتژیک مجمع تشخیص مصلحت نظام منصوب کرد. در متن حکم رئیس مجمع تشخیص مصلحت نظام آمده است: «جناب آقای دکتر علی اکبر ولایتی با توجه به صلاحیت های علمی و مدیریتی جنابعالی و تجربیات فراوانی که در تمامی سال های پس از پیروزی انقلاب اسلامی در خدمت نظام جمهوری اسلامی ایران کسب نموده اید، جنابعالی را به سمت رئیس مرکز تحقیقات استراتژیک مجمع تشخیص مصلحت نظام منصوب می نمایم. رجاء واثق دارم مرکز تحقیقات را در چارچوب سیاست های کلی نظام و با رعایت اساسنامه مصوب و فعال نمودن ارکان مرکز و با استفاده از اختیارات تفویضی اینجانب، به عنوان بازوی تحقیقاتی نظام جمهوری اسلامی و بویژه مجمع تشخیص مصلحت نظام راهبری خواهید کرد. برای جنابعالی و همکارانتان از حضرت حق تعالی آرزوی توفیق روزافزون دارم».