یکی از موضوعاتی که در ماجرای ملی شدن بانک ها سوال برانگیز شد این است که مهندس بازرگان در بیانیه منتشرشده در خرداد 58 از «مدیریت» بانک های خصوصی از سوی دولت می گوید و «مالکیت» را متعلق به مردم می داند، درحالی که در عمل بانک های خصوصی پس از ملی شدن به مایملک دولت بدل شدند.

معین فر که خود پیشنهاددهنده ملی شدن بانک ها در شورای اقتصاد بوده، می گوید: مولوی رئیس کل وقت بانک مرکزی و اردلان وزیر دارایی، «معتقد بودند دولت نباید مدیریت بانک ها را ملی کند، بلکه به صورت موقت می تواند مدیرانی انتخاب کند تا بانک ها را اداره کنند. آقای مولوی خصوصا معتقد بود بانک مرکزی باید برای بانک ها مدیران دوره گذار انتخاب کند و بعد که اوضاع سامان پیدا کرد، مدیران منصوب شده، از بانک ها خارج شوند و مدیران قبلی بانک ها را تحویل خواهند گرفت.»