جعفر توفیقی نخستین گزینه یی است که نام او با آموزش عالی و دانشگاه، در دولت یازدهم گره خورده است. او در آموزش عالی یک وزنه است. زیر و بم مسائل دانشگاه ها را می داند و دغدغه توسعه و کیفیت آموزش عالی را دارد. از همان روزهای اول شروع به کار دولت یازدهم توفیقی مسوول کارگروهی شد که وظیفه اش بررسی مطالبات دانشگاهیان بود. او نخستین سرپرست وزارت علوم دولت یازدهم بود و بیشترین اقدام را در زمینه خواسته های مغفول مانده دانشگاهیان بعد از هشت سال کرد. هر چند بیشتر از آنچه هست طی یک سال و نیم گذشته تبدیل به چهره یی «سیاسی» شد. طی این مدت و در هر دوره از رای اعتماد مجلس به پنج گزینه پیشنهادی دولت برای وزارت