اگر چه سازمان مجازی شکل مبتنی بر وب سازمان سنتی است، اما ویژگی های متعددی دارد که منجر به تفاوت آن با سازمان سنتی می شود. در واقع، ویژگی های منحصر به فرد سازمان های مجازی مانند پراکندگی (به معنای محل پراکنده کارکنان) ، توانمندسازی، پویایی و وابستگی متقابل، آنها را با سازمان های سنتی متفاوت می سازد. در این تعریف، پراکندگی، به محل پراکنده کارکنان سازمان اطلاق می شود؛ توانمندسازی به قدرت و آزادی عمل کارکنان در مسوولیت هایشان اشاره دارد؛ پویایی به تغییرات مداوم در شیوه های سازمانی، سیاست ها و ویژگی های تیم اشاره می کند و وابستگی متقابل، به شبکه و وابستگی متقابل کارمندان به یکدیگر به منظور دستیابی به هدف اشاره دارد. در ادامه به تفاوت های سازمان های مجازی و سنتی با یکدیگر پرداخته می شود.