باشگاه استقلال از سازمان لیگ و فدراسیون فوتبال به خاطر رایی که در مورد پرونده سوپر جام صادر کردند به دادگاه بین المللی ورزش شکایت کرد. علی خطیر، معاون ورزشی باشگاه استقلال هم مدعی شده بود سازمان لیگ برتر و فدراسیون فوتبال اصرار دارند پرونده در دادگاه شهر لوزان سوئیس بررسی شود در حالی که باشگاه استقلال برای کاهش هزینه ها علاقه مند است این دادگاه در شهر دبی و با یک قاضی برگزار شود.

این ادعا که البته با طعنه هم مطرح شد که برخی علاقه مند به سفرهای لاکچری هستند به مذاق سازمان لیگ خوش نیامد و آن را به تندی جواب داد. سایت سازمان لیگ دراین باره می نویسد: «در پی اظهارات یکی از مسوولان باشگاه استقلال مبنی بر دخالت فدراسیون فوتبال و سازمان لیگ در تشریفات رسیدگی به پرونده مطروحه در CAS به اطلاع می رساند: مرجع بین المللی مذکور تابع تشریفات و ضوابط قانونی خود بوده وهمگان موظف به رعایت آن می باشند. لذا ضمن تاکید بر مسوولیت و ماموریت سازمان لیگ برای صیانت از حقوق تمامی باشگاه های فوتبال و در نتیجه ارتقای فوتبال و تذکر جدی به بیان کنندگان مطالبی که باعث تشویش اذهان عمومی می شود اعلام می دارد فدراسیون فوتبال و سازمان لیگ و باشگاه پرسپولیس در ادامه روند پیگیری پرونده فقط اقدامات قانونی را در رابطه با دادگاه CAS انجام داده و وکیل مرتبط با پرونده از طرف فدراسیون فوتبال و سازمان لیگ در دادگاه شرکت می کند. لذا هرگونه اظهارات خلاف واقع در ارکان قضایی فدراسیون پیگیری می شود.» به نظر می رسد مدیریت جدید باشگاه استقلال سرقول خود برای پیگیری ماجرای سوپرجام باقی است و با توجه به کامیابی در پرونده بازیکنی که بابت دعوتنامه خود ادعای غرامت کرده بود می خواهد در این پرونده هم توانایی های حقوقی خود را به رخ بکشد.