بررسی تنوع ژنتیکی قارچ Monosporascus cannonballus عامل بیماری پوسیدگی ریشه و زوال خربزه در ایران با استفاده از نشانگر rep-PCR

بیماری پوسیدگی ریشه و زوال خربزه ناشی از قارچ Monosporascus cannonballus یکی از مهم ترین بیماری های قارچی خربزه در ایران می‫باشد. تاکنون اطلاعی از ساختار ژنتیکی جمعیت های قارچ عامل بیماری در ایران در دست نمی‫باشد. در این بررسی، جدایه های M. cannonballus از بوته های آلوده طالبی، خربزه و هندوانه از مناطق مختلف کشور مانند اصفهان، یزد، تهران، فارس، سمنان، مرکزی، خراسان رضوی، قزوین، سیستان و بلوچستان جمع آوری گردیدند. تنوع ژنتیکی50 جدایه با استفاده از نشانگرrep-PCR و آغازگر های B OX و ERIC با تکثیر قطعاتی از DNA تعیین گردید. اندازه قطعات تکثیر شده بین bp100 تا bp1500در نوسان بود. میانگین تنوع ژنتیکی در بین جدایه های این بیمارگر در کشور 32/0 محاسبه شد. تجزیه خوشه‫ای با استفاده از ضریب تشابه دایس و روش UPGMA وجود 100 درصد تشابه را بین برخی از جدایه ها که از مناطق مختلف جمع آوری شده بودند نشان داد. از نظر ویژگی های مورفولوژیکی نظیر شکل و رنگ پرگنه جدایه ها در محیط کشت و تنوع ژنتیکی مولکولی آنها ارتباط وجود داشت به طوری که بر این اساس و در سطح تشابه 80 درصد جدایه ها در سه گروه مختلف قرار گرفتند. در سطح تشابه70 درصد جدایه ها براساس نوع میزبان در دو گروه مختلف قرار گرفتند. قدرت تمایز بالای این نشانگر نشان داد که می توان از rep-PCR به عنوان یک روش مفید و سریع برای بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های M. cannonballus استفاده کرد.