آنالیز فیلوژنتیک ژن C 3 ویروس تب برفکی جداشده در ایران در سال 1389

در این مطالعه ابتدا توالی نوکلئوتیدی و اسید آمینه ژن C 3 ویروس تب برفکی سروتیپ O ایران جدا شده در سال 1389 تعیین و سپس با توالی ژن C 3 دیگر سویه های سروتیپ O، A، Asia1 و C این ویروس که در بانک ژن ثبت شده اند، مقایسه گردید. بیشترین میزان شباهت توالی نوکلئوتیدی با دو سویه سروتیپ A هندوستان شاملAIND288/07 و AIND360/00 به ترتیب با 74/93 و 58/93 درصد و سویه سروتیپ O ایران (IRN 303-1) با 11/93 درصد مشاهده شد، در حالی که کم ترین میزان شباهت با سویه های سروتیپ A) GAM/5/98/A) و(O (BKF/2/92/O غرب آفریقا به ترتیب با 01/87 و 11/88 درصد مشاهده گردید. بررسی توالی اسیدهای آمینه نیز نشان داد که ژن C 3 مورد مطالعه دارای بیشترین شباهت با سویه سروتیپ A هندوستان (IND 287/96) با 100 درصد و سپس با سویه سروتیپ O ایران (IRN 303-1) با 56/99 درصد بود و کم ترین شباهت را با سویه سروتیپ A غرب آفریقا (GAM/5/98/A) با 96/92 درصد داشت. بررسی های فیلوژنتیک نشان داد که دو سویه ایرانی (Iran/1/2010 و IRN 303-1) در یک خوشه با سویه های سروتیپ A هندوستان قرار گرفتند، هرچند که دو سویه جدا شده از ایران در نهایت در دو شاخه مجزا از هم جدا شدند. همه سویه های مربوط به یک سروتیپ خاص در خوشه های مختلف قرار گرفته و یک خوشه مجزا برای یک سروتیپ خاص مشاهده نشده است. بنابراین احتمالا این ژن بین سرتیپ های مختلف محافظت شده بوده و تغییرات ممکن است ناشی از نوترکیبی تصادفی در بین سروتیپ ها باشد. توالی ژن C 3 سروتیپ O شیوع یافته در ایران در سال 1389 در بانک ژن با شماره HQ663880 ثبت گردید.