تشخیص باکتری های اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا با استفاده از آنالیز ژن 23S rDNA

ژن های DNA ریبوزومی با داشتن ویژگی های منحصر به فرد همچون حضور در تمامی سلول های میکروارگانیسم ها، وجود مقادیر بالایی از این ژن ها در سلول و همچنین وجود نواحی محافظت شده یک کاندیدای مناسب جهت شناسایی طیف بالایی از میکروارگانیسم ها می باشند. هدف از این مطالعه بررسی توالی محافظت شده و اختصاصی ژن 23S rDNA به عنوان یک هدف DNA در افتراق و غربالگری باکتری های اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا بود.
سویه های باکتریایی اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا از کلکسیون کشت میکروبی انستیتو پاستور ایران تهیه گردید. استخراج DNA از سویه های مورد نظر با استفاده از روش جوشاندن صورت گرفت. پس از بررسی منابع و اطلاعات موجود در بانک ژنی، ترادفی از نواحی محافظت شده ی ژن 23S rDNA و نواحی اختصاصی درون ژنی آن با توجه به هم ردیفی توالی ها، در نرم افزار AlignX از مجموعه ی نرم افزار Vector NTI انتخاب شد و PCR (Polymerase chain reaction) انجام گردید.
نتایج حاصل از هم ردیفی قطعه ی اختصاصی ژن 23S rDNA در هر یک از باکتری های مورد بررسی بیانگر وجود قطعه ی ژنی به اندازه ی حدود 880 جفت باز در تمامی باکتری های مورد مطالعه بود. پروب های اختصاصی طراحی شده در هر یک از باکتری های اشریشیا کلی، سالمونلا انتریکا و شیگلا دیسانتری وجود باندهای 226، 444 و 776 جفت بازی را نشان داد.
نتایج به دست آمده در این مطالعه نشان داد که توالی 23S rDNA انتخاب شده در این پژوهش با توجه به محصولات به دست آمده ی حاصل از تکثیر آن، ناحیه ای مناسب و کارامد جهت افتراق و غربالگری سویه های باکتریایی اشریشیا کلی، شیگلا دیسانتری و سالمونلا انتریکا می باشد.