تعیین توالی ژنوم کامل و فیلوژنی جدایه های نژاد شدید ویروس پیچیدگی زرد برگ گوجه فرنگی جدا شده از تاتوره Datura stramomum L. در منطقه بجنورد، ایران

ویروس پیچیدگی زرد برگ گوجه فرنگی، TYLCV) Tomato yellow leaf curl virus) به همراه ده گونه ویروسی و نژادهایشان که به ویروس های شبه TYLCV معروفند عامل خسارت به گوجه فرنگی (Solanum lycopersicum L.) در مناطق گرمسیر، نیمه گرمسیر و معتدل دنیا می باشند. در این بررسی تعداد سه جدایه TYLCV-IL از گیاهان تاتوره در منطقه بجنورد همسانه سازی و ژنوم کامل آنها تعیین توالی گردید. توالی اسید نوکلئیک ژنوم کامل آنها به همراه تعداد نه جدایه TYLCV-IL گزارش شده ازایران و هشت توالی سایر ویروس های Begomovirus گوجه فرنگی از ایران و سایر مناطق دنیا مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج فیلوژنی جدایه ها نشان داد که تکامل جمعیت نژاد TYLCV-IL در ایران وابسته به جغرافیا بوده و صرفنظر از گونه میزبان واریانت های شمال شرق و جنوب ایران به طور مجزا در دو زیرگروه جداگانه قرار گرفتند. جدایه TYLCV-IL[IR:Sh40:07]، GUO76444 از منطقه شیراز با هیچکدام از جمعیت های شمال شرق و جنوب ایران گروه بندی نشد. این جدایه با نژاد تیپ TYLCV-IL گزارش شده از فلسطین اشغالی قرابت نزدیکی داشته و با یکدیگر در یک زیر گروه مجزا قرار گرفتند. نتایج تجزیه فیلوژنی نشان داد که این جدایه از نظر تکاملی به عنوان پل ژنتیکی بین جدایه های TYLCV-IL حوزه مدیترانه ای و ایران محسوب می شود. این اولین گزارش از گیاه تاتوره به عنوان میزبان نژاد TYLCV-IL در ایران و همچنین حضور این نژاد ویروسی در منطقه بجنورد و استان خراسان شمالی می باشد.