آنالیز ترادف نوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت و بررسی منشاء و تکامل آن

ترادف کاملنوکلئوتیدی جدایه ایرانی ویروس موزائیک کوتولگی ذرت (Maize dwarf mosaic virus MDMV-Ir) تعیین گردید. ژنوم ویروس بجز دنباله Poly A انتهایی ʹ3، 9499 نوکلئوتید بود که شامل 139 نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی 5 و 234 نوکلئوتید ناحیه خوانده نشدنی 3 و یک چارچوب باز خواندنی که یک پلی پروتئین با 3042 اسید آمینه را کد می کند را شامل می شد. MDMV-Ir با سایر جدایه های ویروس4/ 86 تا 9/ 91 در صد شباهت نوکلئوتیدی و 9/93 تا 3/ 97 در صد شباهت آمینواسیدی دارد. شباهت نوکلئوتیدی MDMV-Ir با ترادف کامل سایر پوتی ویروس های غلات موجود در GenBank 54 تا 5/ 70 در صد محاسبه گردید. ترادف آمینو اسیدی پروتئین های ویروس با پروتئین های سایر ویروس های غلات 8/ 29 تا 60 در صد مشابهت نشان داد. مقایسه ترادف نوکلئوتیدی و آنالیز فیلوژنتیکی ترادف کامل و پلی پروتئین های حاصله نشان داد که MDMV بیشترین شباهت را با جدایه بلغاری ویروس و در بین پوتی ویروس های غلات بیشترین شباهت را ویروس موزائیک سورگوم دارد. همچنین این آنالیز نشان داد که جمعیت های MDMV یک گروه مونوفیلتیک هستند که از ناحیه مدیترانه منشاء گرفته اند.