مقایسه روش Real-time PCR با استفاده از پرایمر همگانی 23s rRNA و روش کشت خون در تشخیص سپتی سمی

در سراسر دنیا عفونت های جریان خون (Blood Stream Infections، BSI) دارای میزان شیوع و مرگ و میر بالایی هستند که بین 20% تا 70% متغیر می باشد. بنابراین هدف از این مطالعه یافتن یک روش کارآمد برای تشخیصی سپتی سمی در کنار روش کشت، با استفاده از پرایمر همگانی 23S rRNA در تشخیص بیماران مشکوک به سپتی سمی بود.
این مطالعه از نوع توصیفی- مقطعی می باشد که از مهر 1393 تا خرداد 1394 در بیمارستان های آموزشی شهر همدان در دو مرحله آنالیتیکی و کلینیکی انجام گرفت. در مرحله آنالیتیکی حساسیت و اختصاصیت پرایمر با دو باکتری استافیلوکوکوس اورئوس، اشرشیاکلی و همچنین آزمایش بر روی نمونه های DNA غیر باکتریایی مانند نمونه سلولی انسان و نمونه سلولی قارچ ارزیابی شد. در مرحله کلینیکی 121 نمونه بیمار مشکوک به سپتی سمی از بخش مراقبت های ویژه بیمارستان های شهر همدان، با روش Real-time polymerase chain reaction (PCR) و روش کشت خون بررسی گشت و نتایج آنها با هم مقایسه گردید.
حساسیت به دست آمده برای استافیلوکوکوس اورئوس و اشرشیاکلی، دو رونوشت نامبر و پایین ترین حد DNA قابل شناسایی برای پرایمر 5fg می باشد. در روش Real-time PCR تعداد 78/57% (70 مورد) از نمونه ها مثبت و 22/13% (16 مورد) از نمونه ها توسط روش کشت مثبت گردید. همبستگی یا توافق کاپا 2/0 به دست آمد که نشان دهنده توافق ضعیف بین دو روش است.
حساسیت روش Real-time PCR نسبت به روش کشت خون بیشتر است و به علت حساسیت بالا می توان از این پرایمر برای آزمایشات غربالگری نمونه خون بیماران مشکوک به سپتی سمی استفاده کرد.