شناسایی چند شکلی ژن پرایون در گوسفندان نژاد نائینی با استفاده از روش PCR-SSCP، تعیین توالی مستقیم و تجزیه منحنی ذوب

تعیین ژنوتیپ با استفاده از تجزیه و تحلیل مستقیم DNA اهمیت به سزایی در به نژادی گیاهان و جانوران و نیز برای تشخیص و بررسی بی نظمی های ژنتیکی در موجودات مختلف اعم از گیاه، حیوان و همچنین در علم پزشکی قانونی دارد. در حال حاضر روش تجزیه منحنی ذوب یکی از کم هزینه ترین روش های تعیین ژنوتیپ به حساب می آید که می تواند در مطالعات ژنتیکی مورد استفاده قرار گیرد. پژوهش حاضر به منظور شناسایی چند شکلی های تک نوکلئوتیدی در جایگاه ژن پرایون گوسفندی انجام گرفت. پس از استخراج DNA از نمونه خون 145 راس گوسفند نژاد نائینی و تکثیر قطعه مورد نظر توسط واکنش زنجیره ای پلیمراز، ژنوتیپ ها تعیین و برای تایید نتایج به دست آمده از دو روش PCR-SSCP و روش تعیین توالی مستقیم استفاده شد. نتایج نشان داد که در جایگاه ژنی پروتئین پرایون، در مجموع نه ژنوتیپ مشاهده شد. اما به دلیل وجود چندین SNP در قطعه تکثیری، تفکیک هر یک از ژنوتیپ ها با استفاده از تجزیه منحنی ذوب به طور اختصاصی میسر نشد. بنابراین روش تجزیه منحنی ذوب، ژنوتیپ های حاصل از جا به جایی تک نوکلئوتیدی در یک قطعه تکثیری (تک جایگاه) را به راحتی از هم تفکیک کرده، اما به دلیل پیچیدگی های حاصل از حضور چندین جا به جایی در یک قطعه تکثیری (جایگاه های چندگانه) امکان جداسازی اختصاصی ژنوتیپ ها به راحتی میسر نمی باشد. با توجه به مزایای روش تجزیه منحنی ذوب در جداسازی ژنوتیپ ها، پیشنهاد می شود با انجام پژوهش های جدید بتوان محدودیت های این تکنیک برای قطعات تکثیری حامل چند جا به جایی تک نوکلئوتیدی را رفع کرد.