Conception et évaluation de la méthode de transcriptase inverse combinée à une réaction damplification isothermique par loupe pour détecter le virus de la diarrhée virale bovine

Le virus de la diarrhée virale bovine (BVDV) est un agent pathogène chez la vache et a un impact économique important dans le monde. Cette maladie engendre des coûts énormes dans lindustrie du bétail. La méthode de transcriptase inverse en une étape suivie d’une amplification isothermique par loupe (RT-LAMP) a été conçue pour une identification rapide et efficace du virus BVD. Quatre amorces ont été conçues selon la zone non protégée et non traduite de l’extrémité (5'UTR)5' du génome du virus BVD afin de détecter six emplacements différents de l’ARN ciblée. Quatre-vingt échantillons de sang provenant danimaux soupçonnés d'être porteur du BVD ont été simultanément recueillis et testés en utilisant les deux méthodes de RT-PCR et RT-LAMP. Parmi ces derniers, 24 et 20 échantillons positifs ont été respectivement détectés par les méthodes RT-LAMP et RT-PRC. La limite de détection a été estimée à environ 70PFU/mL pour la méthode RT-LAMP. La comparaison des deux méthodes RT-PRC et RT-LAMP a montré que le RT-LAMP représente une méthode sensible et spécifique pour détecter le virus BVD dans des échantillons cliniques.