ارزیابی جامع بیوانفورماتیکی بیان ترشحی هورمون رشد انسانی با توالی های راهنمای مناسب در Escherichia coli: مطالعه In Silico

امروزه، مهندسی ژنتیک و بیوانفورماتیک، تولید انبوه پروتئین های نوترکیب دارویی در باکتری Escherichia coli را که دارای ویژگی های منحصر به فرد بیانی است، به امری معمول و اقتصادی تبدیل کرده است. در این ارزیابی بیوانفورماتیکی، تولید پری پلاسمیک هورمون رشد انسانی بررسی گردید. هدف از انجام این تحقیق، ارزیابی جامع بیوانفورماتیکی 48 توالی راهنمای انسانی توسط پایگاه های داده ی معتبر به منظور بررسی بیان پروتئین نوترکیب هورمون رشد انسانی در میزبان Escherichia coli بود.
با استفاده از پایگاه داده ی قدرتمند SignalP نسخه ی 1/4، صحت و دقت جایگاه برش تعداد 48 توالی راهنما ارزیابی و گزینش شدند. خصوصیات فیزیکوشیمیایی توالی راهنمای باقی مانده، توسط پایگاه های داده ی Genescript و Protparam مورد بررسی قرار گرفتند. قابلیت حل شدن پروتئین، فعالیت ترشحی پس از بیان و ساز و کار انتقال توالی های راهنما توسط پایگاه های داده ی Solpro، ProtCompB و PRED-TAT، بررسی شدند.
بر اساس نتایج به دست آمده به صورت تئوری، توالی های راهنمای مناسب برای اتصال به پروتئین هورمون رشد انسانی به ترتیب فسفوپروتئین بزاقی غنی شده با پرولین (Proline rich protein HaeIII subfamily 1 یا PRH1)، پروتئین ترشح شده ی C10orf99 و پپتید رها کننده ی پرولاکتین (Prolactin-releasing hormone یا PRLH) پیش بینی شد.
بیان ترشحی، مزایایی را در مقابل بیان سیتوپلاسمیک ایجاد می کند. نتایج این تحقیق، نشان داد که با بررسی توالی های راهنمای مختلف در اتصال با پروتئین هورمون رشد انسانی، دستیابی به توالی های دارای پتانسیل و قابلیت بیان ترشحی بهتر امکان پذیر شده است. لازم است در مطالعات آتی صحت این نتایج بررسی گردد.