مطالعه پروتئوم آپوپلاستی لیموترش با استفاده از الکتروفورز دوبعدی در پاسخ به بیماری شانکر باکتریایی

بیماری شانکر باکتریایی مرکبات یکی از بیماری های ویرانگر می باشد که اکثر واریته های تجاری مرکبات را تحت تاثیر قرار می دهد. در مطالعه حاضر تغییرات پروتئوم آپوپلاستی تحت تاثیر آلودگی پاتوژن برای تعیین پاسخ مولکولی گیاه لیمو ترش تحت بررسی دقیق قرار گرفت. به منظور بررسی پروتئوم خارج سلولی از تکنیک پروتئومیکس برای بررسی تغییرات پروتئین آپوپلاست در طی آلودگی استفاده شد. گیاه لیمو ترش با باکتری Xanthomonas citri subsp.citri آلوده شده سپس از گیاهان آلوده شده و سالم در زمان های 4،1 و7 روز پس از آلودگی در سه تکرار بیولوژیکی نمونه برداری شد. پروتئین ها با استفاده از ژل دو بعدی جدا شده و لکه های دارای میزان افتراقی به وسیله اسپکترومتری جرمی شناسایی شدند. در بررسی ژل های الکتروفورز دوبعدی تعداد 63 لکه پروتئین تغییرات معنی داری از نظر فراوانی در تیمارهای 1، 4 و 7 روز پس از آلودگی در مقایسه با گیاهان شاهد نشان دادند. از میان 63 لکه پروتئینی معنی دار 35 لکه پروتئینی به وسیله اسپکترومتری در پایگاه داده ای NCBInr شناسایی شدند. این پروتئین ها در سیستم دفاعی، فتوسنتز، متابولیسم و سایر فرایندهای سلولی دخالت دارند. به نظر می رسد پاتوژن با ایجاد تغییراتی در هموستازی میزبان به تکثیر و توسعه بیماری ادامه می دهد.