بررسی گروه های عملکردی پروتئینی مشترک و غیر مشترک ارقام متحمل و حساس کلزا تحت تنش شوری و خشکی با استفاده از روش پروتئومیک

برای مطالعه پروتئین های مشترک و غیرمشترک پاسخ دهنده به تنش شوری و خشکی در کلزا (Brassica napus L.)، ارقام SW5001 و Sarigol به ترتیب به عنوان نماینده ای از ارقام متحمل و حساس به صورت فاکتوریل با طرح پایه بلوک کامل تصادفی در چهار تکرار در محیط گلخانه کشت شدند. برای بررسی الگوی پروتئینی با استفاده از تجزیه پروتئوم، نمونه های برگی، در دو آزمایش جداگانه دو هفته پس از اعمال تنش شوری و خشکی و در پایان مرحله روزت تهیه شد. استخراج پروتئین از بافت برگی انجام و الکتروفورز بعد اول به روش نوارهای IPG در گیاهان شاهد و تحت تیمار شوری انجام شد. پروتئین ها در بعد دوم با تکنیک SDS-PAGE تفکیک شدند و پس از رنگ-آمیزی با آبی کوماسی تصویر برداری از ژل ها و تجزیه لکه های پروتئینی با نرم افزار PDQuest انجام شد. در نهایت به ترتیب تعداد 17 و 25 لکه پروتئینی معنی دار بین گیاهان شاهد و تحت تنش-های شوری و خشکی در هر دو رقم، تشخیص داده شدند که از این تعداد به ترتیب تعداد 10 و 15 لکه پروتئینی بین دو رقم مشترک و تعداد چهار و شش لکه پروتئینی به ترتیب منحصر به رقم متحمل و تعداد سه و چهار لکه پروتئینی به ترتیب منحصر به رقم حساس تحت تنش های شوری و خشکی بودند. در مجموع از بین تمامی پروتئین های پاسخ دهنده تحت تنش شوری و خشکی در دو رقم SW5001 و Sarigol، سه پروتئین مشترک در هر دو رقم و هر دو تنش شامل Oxygen-evolving enhancer protein 2-chloroplastic،Ribulose-1،5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit و ATP synthase CF1 beta subunit از مهم ترین پروتئین های پاسخ دهنده به تنش های خشکی و شوری شناسایی شدند. این پروتئین ها به سه عضو موثر در سلول یعنی کمپلکس فتوسیستم II، روبیسکو و ATP سنتاز تعلق دارند که به نظر می رسد از مهم ترین اجزای سلول تحت تنش شوری و خشکی باشند. بنابراین افزایش کارایی این سه مجموعه که با افزایش کارایی سلول همراه است، اثرات تنش شوری و خشکی را کم تر خواهد کرد.