شناسائی گونه های تریکودرما با استفاده از توالی یابی جزئی ژن های nrRNA و tef1α همراه با معرفی Trichoderma capillare برای میکوفلور ایران

گونه های تریکودرما به فراوانی در خاک‏های کشاورزی یافت می‏شوند و اغلب آن‏ها بعنوان عامل بیوکنترلی علیه بیمارگرهای گیاهی عمل می‏کنند. آن‏ها همچنین بعنوان تولید‏کننده های صنعتی آنزیم‏ها شناخته می‏شوند. با توجه به اهمیت این قارچ، شناسائی صحیح آن‏ها در سطح گونه ضروری می‏باشد. شناسائی گونه ها مبتنی بر خصوصیات ریخت‏شناسی با توجه به هموپلاسی زیاد در صفات ظاهری مناسب نمی‏باشد. در این تحقیق، 40 جدایه‏ تریکودرما از استان‏های اصفهان، اراک و همدان با استفاده از توالی‏یابی جزئی ژن‏های nrRNA و tef1α شناسائی شد. جدایه ها در محیط PDB کشت شد و توده میسیلیومی با استفاده از کاغذ صافی جمع آوری شد. میسیلیوم‏ها در لیوفیلیزر خشک-‏انجمادی و سپس از آن استخراج DNA شد. واکنش زنجیره‏ای پلی‏مراز جهت تکثیر حدود 550 و 900 جفت باز بترتیب از نواحی ITS و tef1α با استفاده از آغازگر‏های عمومی و تخصصی انجام شد. قطعات تکثیری توالی‏یابی شد و بعد از ویراستاری و جستجو با استفاده از الگوریتم BLASTn، در بانک ژن ذخیره گردید. بر اساس صفات ریخت‏شناسی و آنالیز توالی های نوکلئوتیدی ITS و tef1α، جدایه ها در هفت گروه گونه‏ای شامل Trichoderma harzianum، T. capillare ، T. pleuroticola، T. asperellum، T. koningiopsis، T. brevicompactum و T. virens توزیع شدند. درخت فیلوژنتیکی این جدایه ها با استرین‏های مرجع تیپ بر اساس توالی tef1α ترسیم شد که در آن خوشه‏بندی فیلوژنتیکی تولید شده اصالت گونه‏ای جدایه های مورد بررسی را تایید کرد. این اولین گزارش گونه T. capillare برای میکوفلور ایران است.