تجزیه و تحلیل آماری پپتیدهای ضدسرطان گیاهی با استفاده از محیطR

به رغم پیشرفت های چشمگیر در زمینه درمان سرطان، علاقه به طراحی داروهای جدید افزایش یافته است. برخی از پپتیدهای گیاهی طیف گسترده ای از فعالیت های سیتوتوکسیک را در برابر سلول های سرطانی نشان می دهند. هدف این مطالعه تجزیه و تحلیل آماری پپتیدهای ضد سرطان گیاهی شناخته شده و همچنین یافتن مهمترین ویژگی های مشترک بین آنها بود. در این راستا لیستی از پپتیدهای ضدسرطان گیاهی موجود در پایگاه داده (The Antimicrobial Peptide Database) تهیه و اطلاعات مربوط به هر پپتید استخراج شد. آنالیزهای آماری در محیط نرم افزار R Studio صورت گرفت. نتایج بیانگر آن بود که 55 مورد ثبت شده اغلب از نظر تاکسونومی متعلق به رده Malpighiales بودند. تقریبا 44 درصد پپتیدها طولی در بازه 25 الی 30 اسیدآمینه داشتند. هیستیدین و متیونین کمترین فراوانی را در بین اسیدآمینه های تشکیل دهنده پپتیدها داشتند. سیستئین، سرین و گلیسین فراوانترین اسید آمینه ها بودند. 91 درصد پپتیدها کمتر از 10 اسیدآمینه اسیدی و 71 درصد پپتیدها کمتر از 10 اسیدآمینه بازی داشتند. شارژ خالص 76 درصد پپتیدها بین 2- الی 2 بود. 64 درصد پپتیدها اندکس بومن کمتر از 1 داشتند. پایین بودن این اندکس نشانگر هیدروفوبیسیتی بالای این پپتیدها و افزایش احتمال برهم کنش آنها با سایر پروتئین هاست. همچنین مهمترین ساختار سه بعدی شناخته شده برای پپتیدهای ضد سرطان گیاهی حضور 3 پل دی سولفیدی بود. بنابراین تولیدکنندگان و طراحان دارو می توانند با استفاده از این ویژگی ها که از آنالیزهای آماری پیشرفته استخراج می شوند، نسبت به سنتز یا کشف داروهای موثر جدید با اثرات جانبی کمتر اقدام نمایند.