بررسی اثر دما بر وابستگی اتصال رمدسیویر به آنزیم RdRp ویروس سارس-کووید2 با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی هدایت شده

ویروس مرگ بار سارس-کووید-2 اولین بار اواخر سال 2019، در چین پدیدار شده است. این ویروس توالی مشابهی با ویروس سارس- کووید در سال 2002 داشته، با این تفاوت که سرعت انتقال آن بسیار زیاد می باشد. از طرفی سارس- کووید-2، یک RNA ویروس بوده و برای رونویسی ژنوم ویروسی خود نیازمند آنزیم RdRp است. به سبب در دسترس بودن محل فعال این آنزیم، هدف قرار دادن آن برای مهار تکثیر سارس- کووید-2 یک روش درمانی موثر محسوب می شود. رمدسیویر یک مهارکننده ی ویروس هپاتیت C و ابولا و مورد تایید سازمان غذا و دارو، نتایج مثبتی را در مهار پروتیاز اصلی و RdRp سارس-کووید-2 نشان داده است. هدف از بررسی حاضر مشاهده عملکرد رمدسیویر برای مهار RdRp در دماهای متفاوت با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی هدایت شده، می باشد. بدین منظور رمدسیویر و RdRp پس از اتصال با داکینگ مولکولی در چهار دمای متفاوت (از17 تا 47 درجه سانتی گراد) مورد ارزیابی قرار گرفتند. با توجه به نتایج بدست آمده، نیروی گسیختگی و کار کشیدگی برای جدا شدن رمدسیویر از RdRp، با افزایش دما، کاهش می یابند. همچنین  در دماهای بالاتر، انرژی آزاد گیبس به سبب ارتباط با کار کشیدگی کاهش می یابد.