شناسایی SNPها در نواحی اگزونی واینترونی ژن های لینالول سینتاز و ژرماکرینD سینتاز در گیاه ریحان

ریحان (Ocimum basillicum L.) از مهم ترین گیاهان دارویی حاوی ترکیبات ترپنوییدی از جمله مونوترپن و سزکویی ترپن ها می باشد. ژن های لینالول سینتاز و ژرماکرین D سینتاز از ژن های کلیدی دخیل در سنتز ترپن ها می باشند .در مطالعه حاضر به منظور شناسایی SNPها در این دو ژن در 5 توده مختلف ریحان از نشانگرهای CAPS و توالی یابی استفاده شد. قطعاتی به اندازه 600 و 583 جفت باز از نواحی کدکننده این دو ژن تکثیر و با آنزیم های برشی Pst1 و MseI هضم شد. بعد از توالی یابی و بازیابی قطعه تکثیری هر ژن، شناساییSNPها با استفاده از هم ردیفی توالی های هر ژن در افراد مختلف انجام گرفت. از نه SNP شناسایی شده در ژن لینالول سینتاز، به ترتیب چهار و پنج SNP در ناحیه اینترون و اگزون مشاهده شد. از کلSNP های شناسایی شده در این ژن، 8/77 درصد آنها از نوع همجنس با فراونی 4/44 درصد A/Gو 3/33 درصد T/C و 2/22 درصد آنها از نوع ناهمجنس با فراونی یکسان ناشی از تبدیلات C/G و C/A بود. از 28 SNP شناسایی شده در ژن ژرماکرین D سینتاز، هفت SNP در ناحیه اگزون و 21SNP در ناحیه اینترون شناسایی شد که 8/67 درصد آنها از نوع همجنس با فراوانی 7/35 درصد G/A و 1/32 درصد C/T و 1/32 درصد آنها از نوع ناهمجنس با فراوانی 1/7 درصد T/A، 3/14 درصد G/C و 7/10 درصد C/A بود. نتایج همردیفی توالی ژن ها بین افراد نشان داد که بیشترین جهش در ژن های لینالول سینتاز و ژرماکرین D سینتاز از نوع تبدیل بازهای همجنس A/G و T/C می باشد.