شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با قطر پشم در نژادهای گوسفند ایرانی

هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاه های موثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونه های خون 94 حیوان، شامل 47 راس از نژاد ایرانی زل و 47 راس از نژاد ایرانی لری بختیاری تهیه شد و پس از استخراج DNA، نمونه ها با استفاده از آرایه های Ovine 50k SNP Chip تعیین ژنوتیپ شدند. داده های حاصل به منظور بررسی کیفی آنالیز شدند. پس از این مراحل، در نهایت مجموع 48056 نشانگر SNP مربوط به 90 حیوان آنالیز شدند. نمونه پشم این حیوانات نیز جمع آوری و صفات میانگین قطر الیاف و نسبت الیاف مساوی یا بیشتر از 30 میکرومتر، با استفاده از فناوری OFDA اندازه گیری شدند. در آنالیزهای آماری اثر عوامل ثابت گله، سال تولد و جنس حیوان بررسی شد. پس از شناسایی تاثیرات معنا دار، آزمون پویش ژنومی در نرم افزار PLINK ارزیابی و برای کنترل نرخ اشتباه از تصحیح FDR استفاده شد. با در نظر گرفتن این نتایج در آنالیزهای پویش ژنومی، در مجموع سه جایگاه نشانگری روی کروموزوم های 1 و 6 با یک اثر معنا داری روی صفت نسبت الیافی که مساوی یا بیشتر از 30 میکرومتر هستند، شناسایی شد (05/0p<). بررسی ژن های شناسایی شده در این مناطق نیز نشان دهنده وجود ژن های مهم تاثیرگذار بر کیفیت پشم در این مناطق است.