اثر تعداد و توزیع اثرات QTL بر صحت پیش بینی های ژنومی برخی روش های آماری در یک صفت آستانه ای

هدف این مطالعه استفاده از شبیه سازی تصادفی برای محاسبه ارزش های اصلاحی ژنومی در سناریوهایی با تعداد و توزیع مختلف آماری برای اثرات QTL در یک صفت آستانه ای با استفاده از روش های بیزیA، B، C، L و R بود. برای شبیه سازی سناریوهای مختلف، ابتدا یک نسل پایه با تعداد 100 حیوان ایجاد شد که به مدت 50 نسل با هم آمیزش تصادفی داشتند. جمعیت مرجعی با اندازه 1000 حیوان از تلاقی تصادفی افراد نسل 50 ایجاد شد و برای این حیوانات یک صفت آستانه ای شبیه سازی شد. از تلاقی تصادفی افراد جمعیت مرجع، جمعیت تایید ایجاد شد که فاقد اطلاعات فنوتیپی بودند. برای هر حیوان، ژنومی به طول 10 مورگان شبیه سازی شد و 10000 نشانگر با فواصل یکسان بر روی آن قرار گرفت. در هر سناریو QTL هایی با توزیع مختلف برای اثرات آن به صورت تصادفی بر روی ژنوم پخش شد. اثرات نشانگرها در جمعیت مرجع به وسیله روش های مختلف بیزی برآورد گردید و ارزش های اصلاحی ژنومی حیوانات فاقد فنوتیپ جمعیت تایید با استفاده از این اثرات محاسبه شد. صحت ارزش های اصلاحی مبنای مقایسه سناریوهای مختلف این تحقیق قرار گرفت. در روش های بیزی مورد بررسی به استثنای روش بیزی R و L که در همه سناریوها صحت مشابهی داشتند، در بین سایر روش های بیزی، بیز B با تعداد دهQTL و توزیع گاما بالاترین صحت ارزش های اصلاحی را داشت. با افزایش تعداد QTL ها صحت ارزش های اصلاحی برآوردی با استفاده از روش های بیزی A، B وC کمتر شد، به گونه ای که برای تعداد 150 QTL و بالاتر صحت ارزش های اصلاحی آنها تقریبا برابر با روش بیزی R و L شد. به طور کلی نتایج این پژوهش نشان داد که روش های آماری مقایسه شده در معماری متفاوت صفت نتایج متفاوتی ارائه می دهند، ولی می توان برای صفات آستانه ای که با تعداد کمی ژن کنترل می شوند یا دارای یک یا چند ژن با اثر عمده هستند، از روش هایی مانند بیز B استفاده کرد.