تاثیر هفت ترکیب مختلف موجود در عصاره شاهدانه بر میزان تجمع پپتید آمیلوئید موجود در بیماری آلزایمر از طریق شبیه سازی مولکولی

بیماری آلزایمر یک بیماری پیشرونده مغزی با آسیب جبران ناپذیر است که به تدریج توانایی های ذهنی بیمار تحلیل می رود. در این تحقیق 7 ترکیب مختلف موجود در عصاره شاهدانه در مواجهه با پپتید آمیلوئید قرار گرفته و سپس تغییر ساختار و پارامترهای ترمودینامیکی مورد ارزیابی قرار گرفت.
این مطالعه از نوع شبیه سازی مولکولی با کمک رایانه بود. نخست ساختار سه بعدی پپتید آمیلوئید بتا در بیماران دارای بیماری آلزایمر از بانک اطلاعاتی RCSB تهیه گردید. همچنین ترکیبات اصلی عصاره شاهدانه از دیتابیس CHEBI استخراج شد. سپس هر کدام از مولکول های عصاره شاهدانه به طور جداگانه در محیط نرم افزار شبیه ساز دینامیک مولکولی در معرض پپتید آمیلوئید قرار گرفته و مشخصات ساختاری و ترمودینامیکی آن در مدت 3000 پیکوثانیه مورد ارزیابی قرار گرفت. برای تجزیه و تحلیل داده ها مقادیر مطلق هر پارامتر فیزیکی قبل و بعد از مواجهه یادداشت و سپس اختلاف قبل و بعد محاسبه گردید و در انتها درصد تغییرات با هم مقایسه شد.
مقایسه هفت ترکیب مختلف عصاره شاهدانه نشان داد که همه ترکیبات عصاره شاهدانه توانایی تغییر در ساختار پپتید آمیلوئید را داشتند. هر هفت ترکیب توانستند حجم، سطح موثر و انحلالیت در چربی پپتید آمیلوئید را تغییر دهند.
توانایی تغییر حجم و سطح توسط این ترکیبات می تواند مانع تجمع پپتید آمیلوئید شود. یافته ها ی این تحقیق می بایست در محیط آزمایشگاهی و سپس در بدن انسان مورد بررسی قرار گیرد تا به طور قطع بتوان در مورد کارایی ترکیبات شاهدانه قضاوت کرد.