ارزیابی ژنومی تک مرحله ای (Single Step GBLUP): مطالعه موردی در ارزیابی ژنومی گاو گوشتی

روش تک مرحله ای (SS-GBLUP) انتخاب ژنومی در مقایسه با روش چند مرحله ای، با توجه به ادغام ماتریس خویشاوندی روابط ژنومی آللی و ماتریس خویشاوندی شجره ای و استفاده هم زمان تمام حیوانات ژنوتیپ شده و نشده در مدل های ژنومی اخیرا کاربرد وسیعی در برآورد ارزش های اصلاحی ژنومی ایفا کرده است. هدف از مطالعه اخیر مقایسه تفاوت صحت ارزیابی ژنومی برای روش های BLUP سنتی، G-BLUP، SNP-BLUP و SS-GBLUP برای صفت وزن لاشه در گاو گوشتی بود. نتایج این مطالعه نشان داد که متوسط صحت پیش بینی ژنومی روش های فوق به ترتیب برابر با 11/0±77/0، 21/0±88/0، 23/0±87/0 و 25/0± 95/0 برآورد شد. صحت پیش بینی ژنومی در روش SS-GBLUP نسبت به روش های BLUP سنتی، G-BLUP و SNP-BLUP به ترتیب 18/0، 07/0 و 08/0 بیش تر برآورد شد. میانگین مربعات خطای پیش بینی برای روش های فوق به ترتیب 46/3، 21/2، 22/2 و 76/1 به دست آمد. روش SS-GBLUP با توجه به پایین بودن میانگین مربعات خطا و بالا بودن صحت پیش بینی ژنومی روش مطلوب تری بود. ضرایب رگرسیون پیش بینی ژنومی برای روش های SNP-BLUP، G- BLUP و SS-GBLUP به ترتیب 81/0، 82/0 و 90/0 به دست آمد و بنابراین اریب برآوردها در SS-GBLUP نسبت به دو روش دیگر کمتر است.