|  درخواست عضويت  |  رمز خود را فراموش کرده ايد؟  |  ورود اعضا [Sign in]
جستجوي پيشرفته مطالب   |  
 جستجو:  
magiran.com >  دو فصلنامه پژوهش هاي سلولي و ملكولي >سال نهم، شماره 2 > متن
مشخصات نشريه
آخرين شماره
آرشيو شماره هاي گذشته
جستجوي مطالب
سايت اختصاصي
تماس با نشريه
ارسال الکترونيکي مقاله
شماره جديد اين نشريه
سال دهم
شماره 1


 راهنمای موضوعی نشريات
اين نشريه در گروه(های) زير قرار گرفته است:

خدمات سايت




 


Journal of Cell and Molecular Research, 2018(Issue 2)



Title:
Systems Biology Analysis of the Key Genes of Surfactin Production in Bacillus subtilis MJ01 (Isolated from Soil Contaminated Oil in South of Iran), Spizizenii, and 168 Isolates


Author(s):
Tahereh Deihimi , Esmaeil Ebrahimie , Ali Niazi , Mansour Ebrahimi , Shahab Ayatollahi , Ahmad Tahmasebi , Touraj Rahimi , Moein Jahanbani Veshareh

Paper language: English


Abstract:
Applying microorganism in oil recovery has attracted attentions recently. Surfactin produced by Bacillus subtilis is widely used industrially in a range of industrial applications in pharmecutical and environmental sectors. Little information about molecular mechanism of suffactin compound is available. In this study, we performed promoter and network analysis of surfactin production genes in Bacillus subtilis subsp. MJ01 (isolated from oil contaminated soil in South of Iran), spizizenii and 168. Our analysis revealed that comQ and comX are the genes with sequence alterations among these three strains of Bacillus subtilis and are involved in surfactin production. Promoter analysis indicated that lrp, argR, rpoD, purr and ihf are overrepresented and have the highest number of transcription factor binding sites (TFBs) on the key surfactin production genes in all 3 strains. Also the pattern of TFBs among these three strains was completely different. Interestingly, there is distinct difference between 168, spizizenii and MJ01 in their frequency of TFs that activate genes involve in surfactin production. Attribute weighting algorithms and decision tree analysis revealed ihf, rpoD and flHCD as the most important TF among surfactin production. Network analysis identified two significant network modules. The first one consists of key genes involved in surfactin production and the second module includes key TFs, involved in regulation of surfactin production. Our findings enhance understanding the molecular mechanism of surfactin production through systems biology analysis.

Keywords:
Surfactin production gene; Transcription factor (TF); Promoter analysis; Network analysis
 

دوست گرامي:

    با تشکر از همراهي شما به اطلاع مي رساند مطالعه متن مقالات نشريات و خدمات اختصاصي اين سايت تنها براي اعضا و با پرداخت حق عضويت (اشتراک طلايي) امکان پذير است.

  هزینه حق عضویت سالانه(اشتراک طلایی):

  • مشترکان داخل کشور     250.000 ريال (100 مقاله اعتبار اولیه) پرداخت با همه کارتهای بانکی
  • مشترکان خارج از کشور   50 دلار  (100 مقاله اعتبار اولیه) پرداخت با  Paypal
  اگر عضو سايت هستيد:
     شناسه کاربري:
     رمز عبور:

  اگر عضو سايت نيستيد:
شما با تکميل فرم عضويت و تاييد نشاني ايميل خود در سايت "بانک اطلاعات نشريات کشور magiran.com"  مي توانيد از امکانات اختصاصي اين سايت به شرح زير استفاده نماييد.:
  • دسترسي به متن مقالات پس از پرداخت حق عضويت و فعال سازی اشتراک طلايي
  • استفاده از  فروشگاه سايت و سفارش اينترنتي اشتراک نسخه چاپي نشريات با 10 درصد تخفيف
  • ايجاد فهرست نشريات مورد علاقه براي دسترسي سريع
  • اطلاع از انتشار نشريات مورد علاقه از طريق پست الکترونيکي
  • دريافت روزانه سرخط مطالب روزنامه هاي عضو بر اساس کلمات انتخابي خودتان تا سقف 10 عنوان


آيا مايل به عضويت در بانک اطلاعات نشريات کشور هستيد؟ 
(رايگان)

          

 



 

 

 
 
ارسال مطلب به دوستان
نظر بدهيد
ثبت در فهرست علائق

معرفی سايت به ديگران
گزارش اشکال در اطلاعات
اشتراک نشريات ديگر
 جستجوی مطالب
کلمه مورد نظر خود را وارد کنيد

جستجو در:
آرشيو اين مجله
همه مجلات عضو
مجلات علمی مصوب
متن روزنامه های عضو
    
جستجوی پيشرفته



 

اعتماد
ايران
جام جم
دنياي اقتصاد
رسالت
شرق
كيهان
 پيشخوان
Dental Hypotheses
شماره 3 (پياپي 903)
 

 

 

سايت را به دوستان خود معرفی کنيد    
 1397-1380 کليه حقوق متعلق به سايت بانک اطلاعات نشريات کشور است.
اطلاعات مندرج در اين پايگاه فقط جهت مطالعه کاربران با رعايت شرايط اعلام شده است.  کپی برداري و بازنشر اطلاعات به هر روش و با هر هدفی ممنوع و پيگيرد قانوني دارد.
 

پشتيبانی سايت magiran.com (در ساعات اداری): 77512642  021
تهران، صندوق پستی 111-15655
فقط در مورد خدمات سايت با ما تماس بگيريد. در مورد محتوای اخبار و مطالب منتشر شده در مجلات و روزنامه ها اطلاعی نداريم!
 


توجه:
magiran.com پايگاهی مرجع است که با هدف اطلاع رسانی و دسترسی به همه مجلات کشور توسط بخش خصوصی و به صورت مستقل اداره می شود. همکاری نشريات عضو تنها مشارکت در تکميل و توسعه سايت است و مسئوليت چگونگی ارايه خدمات سايت بر عهده ايشان نمی باشد.



تمامي خدمات پایگاه magiran.com ، حسب مورد داراي مجوزهاي لازم از مراجع مربوطه مي‌باشند و فعاليت‌هاي اين سايت تابع قوانين و مقررات جمهوري اسلامي ايران است