ساده سازی مدل هم ترازی شبکه های برهم کنش پروتئین- پروتئین با استفاده از ماتریس شباهت به منظور کاهش زمان حل
نویسنده:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (بدون رتبه معتبر)
چکیده:
مسئله هم ترازی شبکه های پروتئینی، یک مساله NP-Complete است. در این مقاله، برای کاهش پیچیدگی حل مدل ریاضی مساله هم ترازی، تقریبی از مدل ارائه می شود. به عبارت دقیق تر، از ماتریس شباهت دو شبکه پروتئینی برای کاهش تعداد متغیرهای مدل استفاده می گردد. برای این منظور، در مدل پیشنهادی، به جای بررسی هم ترازی هر یک از پروتئین های شبکه نخست با تمام پروتئین های شبکه دوم، هم ترازی هر یک از پروتئین های شبکه نخست فقط با تعدادی از شبیه ترین پروتئین های شبکه دوم بررسی می شود. مدل پیشنهادی، برای همترازی شبکه های پروتئینی واقعی گونه های مختلف و نیز شبکه های مصنوعی آزمایش شد. نتایج تجربی، نشان دهنده بهبود دقت هم ترازی نسبت به روش تقریبی NETAL و نیز کاهش زمان اجرا، نسبت به مدل دقیق می باشد. در ضمن، روش پیشنهادی، توانسته است بر روی شبکه های مصنوعی فاقد نویز، به دقت بسیار مطلوب دست یابد.
کلیدواژگان:
زبان:
فارسی
صفحات:
10 تا 20
لینک کوتاه:
magiran.com/p1817089
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یکساله به مبلغ 990,000ريال میتوانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
- حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران میشود.
- پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانههای چاپی و دیجیتال را به کاربر نمیدهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required
Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!