|  درخواست عضويت  |  رمز خود را فراموش کرده ايد؟  |  ورود اعضا [Sign in]
جستجوي پيشرفته مطالب   |  
 جستجو:  
ارزيابي توالي رونوشت گياه دارويي زيره سبز (Cuminum cyminum) با استفاده از RNA-Seq
magiran.com >  مجله بيوتكنولوژي كشاورزي >سال نهم، شماره 4 (پياپي 28) > متن
مشخصات نشريه
آخرين شماره
آرشيو شماره هاي گذشته
جستجوي مطالب
سايت اختصاصي
تماس با نشريه
ارسال الکترونيکي مقاله
راهنماي تدوين و ارسال مقالات
شماره جديد اين نشريه
سال نهم
شماره 4
(پياپي 28)
زمستان 1396


 راهنمای موضوعی نشريات
اين نشريه در گروه(های) زير قرار گرفته است:
1 بيوتکنولوژي و ژنتيک گياهي

خدمات سايت




 


مجله بيوتكنولوژي كشاورزي ، سال نهم، شماره 4 (پياپي 28)



عنوان:
ارزيابي توالي رونوشت گياه دارويي زيره سبز (Cuminum cyminum) با استفاده از RNA-Seq


نويسنده(گان):
داريوش صادقي، سيد محمدمهدي مرتضويان *، محمدرضا بختياري زاده،


چکيده:
زيره سبز (Cuminum cyminum L.) گياهي گلدار از خانواده چتريان (Apiaceae) است كه بومي مناطق شرق مديترانه تا هند مي باشد. به رغم اهميت دارويي فراوان زيره سبز، اطلاعات بسيار اندكي از ژنوم و مكانيسم هاي بيوشيميايي تركيبات موجود در اين گياه وجود دارد. در مطالعه حاضر جهت ارزيابي توالي رونوشت زيره سبز، از اندام گل (به دليل تجمع بالاي تركيبات آلدئيدي و محل اصلي بيوسنتز آن)، جهت استخراج RNA از چهار نمونه و انجام آناليز هاي RNA-Seq استفاده شد. در نهايت، بيش از 153 ميليون خوانش به طول 50 باز از توالي يابي اين نمونه ها حاصل شد. سرهم بندي خوانش ها به منظور ايجاد رونوشت هاي بيان شده توسط نرم افزار Trinity (نسخه 3 . 1 . 1) و با مقادير kmer 25 و 32 انجام شد. بهترين سرهم بندي بر اساس كامل بودن توالي رونوشت ها با استفاده از نرم افزار BUSCO (نسخه 3) شناسايي شد. بعد از سرهم بندي خوانش ها 50973 توالي ژن (كانتيگ) با ميانگين طول 725 باز و مقدار N50 برابر با 1136 باز به دست آمد. همچنين از اين تعداد ژن، 53103 رونوشت شناسايي شد. از اين تعداد، 35860 رونوشت داراي حداقل يك همولوگ در بانك اطلاعاتي Nr بودند. بيش از 7/66 درصد رونوشت ها حداقل داراي يك همولوگ در بانك اطلاعاتي GO (فرآيند هاي بيولوژيك، عملكرد هاي مولكولي و اجزاء سلولي) بودند. بيشتر ژن هاي شناسايي شده مرتبط با تنظيم رونويسي و فعاليت هاي غشايي بودند. در مطالعه حاضر نخستين پروفايل توالي رونوشت در گياه زيره گزارش شد كه مي تواند در مطالعات بعدي به منظور شناسايي ژن هاي دخيل در مسير بيوسنتزي تركيبات ثانويه مختلف و ديگر مطالعات ژنتيكي در اين گياه مورد استفاده قرار گيرد.

کليدواژگان:
رونوشت ژن، زيره سبز، گياه دارويي، نسل دوم توالي يابي


لينک کوتاه به اين صفحه:  
 

دوست گرامي:

    با تشکر از همراهي شما به اطلاع مي رساند مطالعه متن مقالات نشريات و خدمات اختصاصي اين سايت تنها براي اعضا و با پرداخت حق عضويت (اشتراک طلايي) امکان پذير است.

  هزینه حق عضویت سالانه(اشتراک طلایی):

  • مشترکان داخل کشور     250.000 ريال (100 مقاله اعتبار اولیه) پرداخت با همه کارتهای بانکی
  • مشترکان خارج از کشور   50 دلار  (100 مقاله اعتبار اولیه) پرداخت با  Paypal
  اگر عضو سايت هستيد:
     شناسه کاربري:
     رمز عبور:

  اگر عضو سايت نيستيد:
شما با تکميل فرم عضويت و تاييد نشاني ايميل خود در سايت "بانک اطلاعات نشريات کشور magiran.com"  مي توانيد از امکانات اختصاصي اين سايت به شرح زير استفاده نماييد.:
  • دسترسي به متن مقالات پس از پرداخت حق عضويت و فعال سازی اشتراک طلايي
  • استفاده از  فروشگاه سايت و سفارش اينترنتي اشتراک نسخه چاپي نشريات با 10 درصد تخفيف
  • ايجاد فهرست نشريات مورد علاقه براي دسترسي سريع
  • اطلاع از انتشار نشريات مورد علاقه از طريق پست الکترونيکي
  • دريافت روزانه سرخط مطالب روزنامه هاي عضو بر اساس کلمات انتخابي خودتان تا سقف 10 عنوان


آيا مايل به عضويت در بانک اطلاعات نشريات کشور هستيد؟ 
(رايگان)

          

 



 

 

 
 
ارسال مطلب به دوستان
نظر بدهيد
ثبت در فهرست علائق

معرفی سايت به ديگران
گزارش اشکال در اطلاعات
اشتراک نشريات ديگر
 جستجوی مطالب
کلمه مورد نظر خود را وارد کنيد

جستجو در:
آرشيو اين مجله
همه مجلات عضو
مجلات علمی مصوب
متن روزنامه های عضو
    
جستجوی پيشرفته



 

اعتماد
ايران
جام جم
دنياي اقتصاد
رسالت
شرق
كيهان
 پيشخوان
Journal of nephropathology
متن مطالب شماره 4 (پياپي 704)، Oct 2018را در magiran بخوانيد.

 

 

 

سايت را به دوستان خود معرفی کنيد    
 1397-1380 کليه حقوق متعلق به سايت بانک اطلاعات نشريات کشور است.
اطلاعات مندرج در اين پايگاه فقط جهت مطالعه کاربران با رعايت شرايط اعلام شده است.  کپی برداري و بازنشر اطلاعات به هر روش و با هر هدفی ممنوع و پيگيرد قانوني دارد.
 

پشتيبانی سايت magiran.com (در ساعات اداری): 77512642  021
تهران، صندوق پستی 111-15655
فقط در مورد خدمات سايت با ما تماس بگيريد. در مورد محتوای اخبار و مطالب منتشر شده در مجلات و روزنامه ها اطلاعی نداريم!
 


توجه:
magiran.com پايگاهی مرجع است که با هدف اطلاع رسانی و دسترسی به همه مجلات کشور توسط بخش خصوصی و به صورت مستقل اداره می شود. همکاری نشريات عضو تنها مشارکت در تکميل و توسعه سايت است و مسئوليت چگونگی ارايه خدمات سايت بر عهده ايشان نمی باشد.



تمامي خدمات پایگاه magiran.com ، حسب مورد داراي مجوزهاي لازم از مراجع مربوطه مي‌باشند و فعاليت‌هاي اين سايت تابع قوانين و مقررات جمهوري اسلامي ايران است