شناسایی ژن های کلیدی دخیل در تحمل به تنش شوری در گندم با استفاده از آنالیز داده های ریزآرایه

تنش شوری یکی از مهمترین عوامل محدود کننده محیطی در تولید گندم می باشد و تحقیقات در راستای ایجاد ارقام متحمل به تنش شوری از اهمیت فوق العاده ای برخوردار است. شناسایی ژن ها و سازوکارهای دخیل در تحمل به شوری در راستای اصلاح مولکولی این گیاه برای تحمل به شوری ضروری است. در این تحقیق به منظور شناسایی ژن های پاسخ-دهنده به تنش شوری در گندم، دو سری داده ریزآرایه مرتبط با تنش شوری گندم از پایگاه داده NCBI مورد آنالیز قرار گرفتند. نتیجه این تجزیه و تحلیل، شناسایی 3096 و 2060 ژن پاسخ دهنده به تنش شوری به ترتیب در ریشه و اندام هوایی بود. نتایج هستی شناسی (Ontology) ژن-های افتراقی در هر دو بافت نشان داد که این ژن ها در بخش فرایندهای زیستی برای پاسخ به محرک های شیمیایی، پاسخ به تنش اکسیداتیو، انتقال، تنظیم رونویسی و پردازش متالبولیکی کربوهیدرات ها و در بخش عملکرد مولکولی برای فعالیت کاتالیتیکی، فعالیت اتصال و فعالیت اکسیدوردوکتازی دارای فراوانی بالای معنی داری بودند. همچنین، به منظور تعیین ژن های کلیدی در ایجاد تحمل به شوری، ژن های پاسخ دهنده در ریشه تحت آنالیز هاب قرار گرفتند. بر اساس نتایج به دست آمده، نقش ژن های تنظیم کننده ای مانند پروتئین کینازها، پروتئین فسفاتازها و عوامل رونویسی همانند MYB و WRKY در ایجاد تحمل به تنش شوری مورد تاکید قرار گرفت.