شناسایی، طبقه بندی و آنالیز بیان بیوانفورماتیکی خانواده ژنی عوامل نسخه برداری NAC در ژنوم Hordeum vulgare cv. Morex

خانواده ژنی NAC یک خانواده بزرگ عوامل نسخه برداری اختصاصی گیاهی است که نقش های متنوعی در مراحل نمو گیاهی و پاسخ به تنش ها ایفا می کند. با تکمیل پروژه توالی یابی ژنوم Hordeum vulgare cv. Morex امکان مطالعات بیوانفورماتیکی خانواده ژنی NAC در جو فراهم گردید. در این پژوهش با استفاده از پایش ژنومی، در کل 73 ژن غیرتکراری رمزکننده NAC در توالی های ژنومی Hordeum vulgare cv. Morex شناسایی شد. یک درخت تبارشناسی مرکب با توالی های پروتئینی HvNAC و تعدادی از توالی های پروتئینی NAC شناخته شده برنج و آرابیدوپسیس ترسیم شد و آنها به 15 زیرگروه مشخص طبقه بندی شدند. مشخص شد که پراکنش ژن های HvNAC روی کروموزوم های جو غیریکنواخت است. بیشتر ژن های NAC به صورت انفرادی قرار گرفته اند و معدودی از آنها با دو یا سه ژن خوشه بندی شده اند. بیشتر عناصر cis ردیابی شده در نواحی بالادست و پایین دست ژن های HvNAC در پاسخ به نور، پاسخ به تنش های غیرزیستی و به مقدار نسبتا اندک در پاسخ به تنش-های زیستی دخیل هستند. در آنالیز in silico بیان ژن، ژن های HvNAC در دامنه گسترده ای از بافت های مختلف بیان شدند و در مراحل نموی به-طور عمده بیان نشدند، همچنین، ژن های HvNAC در شرایط تنش غیرزیستی تا حدودی و به مقدار نسبتا کمتر در تنش های زیستی بیان شدند. این اطلاعات بیوانفورماتیکی چارچوبی برای مطالعات ژنومی و عملکردی این خانواده ژنی در جو فراهم می کند.