تحلیل فیلوژنتیکی خانواده ژنی NAC در سورگوم دانه ای و بررسی الگوی بیانی اعضای دخیل در پاسخ به تنش خشکی

نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
سورگوم علی رغم تحمل قابل توجه به خشکی، در دوران قبل و بعد از گلدهی در صورت مواجهه با تنش خشکی، دچار کاهش عملکرد دانه ای می شود. عوامل رونویسیNAC ، نقش کلیدی در سازگاری سورگوم به خشکی ایفا می کنند. در این مطالعه، اطلاعات مربوط به خانواده پروتئینیNAC از پایگاه های اطلاعاتی جمع آوری شد. سپس، مدل مخفی مارکوف دمین NAC (PF02365) بر علیه پروتئین های سورگوم مورد جستجو قرار گرفت. در مجموع، 183 توالی پروتئینی کدشونده توسط 131 مکان ژنی شناسایی شدند. درخت فیلوژنی بر اساس دمینNAC خانواده ژنیNAC سورگوم، به همراه 11 توالی پروتئینی شناخته شده در سایر گیاهان، با روش نزدیک ترین همسایه ها ترسیم شد که این خانواده را به 15 زیرخانواده طبقه بندی نمود. 13 عضو از خانواده پروتئینی NAC سورگوم به زیرخانوادهSNAC های سایر گیاهان پیوستند که احتمالا در تحمل به تنش های غیرزیستی دخیل باشند. 14 نوع عنصر تنظیمی پاسخ دهنده به تنش ها و هورمون ها در راه انداز ژن های زیر گروه SNAC پیش بینی شد. به منظور بررسی الگوی بیانی نسبی ژن های SNAC، کشت مزرعه ای به صورت اسپلیت پلات در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی اجرا شد. آبیاری در دو سطح شامل آبیاری معمولی و تنش خشکی (قطع آبیاری پس از گلدهی) و ارقام در دو سطح شامل کیمیا (متحمل) و سپیده (حساس) لحاظ گردید. با توجه به الگوی بیانی SbSNAC ها، انتظار می رود که برخی از اعضا به عنوان تنظیم کننده های رونویسی مثبت (سه عضو) و منفی (سه عضو) در پاسخ به تنش خشکی پس از گلدهی در سورگوم فعالیت کنند. همچنین، برخی در پیری برگ (دو عضو) و فرایند انتقال مجدد فلزات (دو عضو) نقش دارند.
زبان:
فارسی
صفحات:
1 تا 15
لینک کوتاه:
magiran.com/p1867602 
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 1,390,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 70 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!