|  درخواست عضويت  |  رمز خود را فراموش کرده ايد؟  |  ورود اعضا [Sign in]
جستجوي پيشرفته مطالب   |  
 جستجو:  
magiran.com >  مجله بولتن پيشرفته علوم دارويي >سال هشتم، شماره 3 > متن
مشخصات نشريه
آخرين شماره
آرشيو شماره هاي گذشته
جستجوي مطالب
سايت اختصاصي
تماس با نشريه
ارسال الکترونيکي مقاله
شماره جديد اين نشريه
سال نهم
شماره 1


 راهنمای موضوعی نشريات
اين نشريه در گروه(های) زير قرار گرفته است:

?????


 


Advanced Pharmaceutical Bulletin, 2018(Issue 3)



Title:
Simulation and Stability Assessment of Anti-EpCAM Immunotoxin for Cancer Therapy


Author(s):
Seyed, Ali Hosseinian , Aliakbar Haddad, Mashadrizeh , Samaneh Dolatabadi , *

Paper language: English


Abstract:
Purpose

Epithelial cell adhesion molecule (EpCAM) is a dominant antigen in human colon carcinoma tissue. Topology features of this antigen are different in normal and malignant conditions; for instance, EpCAM is much less accessible to antibodies in normal cells than in cancerous tissues. Hence, EpCAM has been considered as a suitable candidate for cancer target therapy via immunotoxins (ITs) development. In this study, attention was focused on the stability assessment of anti-EpCAM-IT (anti-Ep-IT) to design a novel IT.


Methods

The 3D structures of the antibody template and the toxin segment of anti-Ep-IT were retrieved from PDB. Discovery Studio3.0 was used to separate the ligands and water molecules. The antibody (Ab) fragment of anti-Ep-IT was aligned using protein blast (BLAST-p), and SWISS-MODEL database was used for Ab modeling. IT modeling was accomplished using MODELLER 9.15. Also, GROMACS 5.07 was used for molecular dynamic (MD) simulation step. Moreover, ERRAT and RAMPAGE databases were used for quality assessment of the structures.


Results

BLAST-p results indicated that antibody moiety of IT has the highest E-value and query coverage scores to the monoclonal antibody (mAb) 4D5MOC-B. Modeling by SWISS-MODEL provided a reasonable template for Ab portion compared to MODELLER. The best modeled full-length IT with the lowest RMSD values was selected. Finally, RMSD plot for MD stage demonstrated constant values from 7000ps to 20000ps.


Conclusion

In general, both modeling results and their quality evaluations were satisfactory for designing IT. Moreover, RMSD plot revealed that IT stability was preserved during the simulation. Overall, our findings led to modeling and simulation of the anti-Ep-IT with more structural stability.



Keywords:
EpCAM, Cancer therapy, Immunotoxin, Simulation, Stability
 

دوست گرامي:

    با تشکر از همراهي شما به اطلاع مي رساند مطالعه متن مقالات نشريات و خدمات اختصاصي اين سايت تنها براي اعضا و با پرداخت حق عضويت (اشتراک طلايي) امکان پذير است.

  هزینه حق عضویت سالانه(اشتراک طلایی):

  • مشترکان داخل کشور     250.000 ريال (100 مقاله اعتبار اولیه) پرداخت با همه کارتهای بانکی
  • مشترکان خارج از کشور   50 دلار  (100 مقاله اعتبار اولیه) پرداخت با  Paypal
  اگر عضو سايت هستيد:
     شناسه کاربري:
     رمز عبور:

  اگر عضو سايت نيستيد:
شما با تکميل فرم عضويت و تاييد نشاني ايميل خود در سايت "بانک اطلاعات نشريات کشور magiran.com"  مي توانيد از امکانات اختصاصي اين سايت به شرح زير استفاده نماييد.:
  • دسترسي به متن مقالات پس از پرداخت حق عضويت و فعال سازی اشتراک طلايي
  • استفاده از  فروشگاه سايت و سفارش اينترنتي اشتراک نسخه چاپي نشريات با 10 درصد تخفيف
  • ايجاد فهرست نشريات مورد علاقه براي دسترسي سريع
  • اطلاع از انتشار نشريات مورد علاقه از طريق پست الکترونيکي
  • دريافت روزانه سرخط مطالب روزنامه هاي عضو بر اساس کلمات انتخابي خودتان تا سقف 10 عنوان


آيا مايل به عضويت در بانک اطلاعات نشريات کشور هستيد؟ 
(رايگان)

          

 



 

 

 
 
ارسال مطلب به دوستان
نظر بدهيد
ثبت در فهرست علائق

معرفی سايت به ديگران
گزارش اشکال در اطلاعات
اشتراک نشريات ديگر



 

اعتماد
ايران
جام جم
دنياي اقتصاد
رسالت
شرق
كيهان
 پيشخوان
ماهنامه دنياي پردازش
متن مطالب شماره 32 (پياپي 76)، ارديبهشت 1398را در magiran بخوانيد.

 

 

 

سايت را به دوستان خود معرفی کنيد    
 1397-1380 کليه حقوق متعلق به سايت بانک اطلاعات نشريات کشور است.
اطلاعات مندرج در اين پايگاه فقط جهت مطالعه کاربران با رعايت شرايط اعلام شده است.  کپی برداري و بازنشر اطلاعات به هر روش و با هر هدفی ممنوع و پيگيرد قانوني دارد.
 

پشتيبانی سايت magiran.com (در ساعات اداری): 77512642  021
تهران، صندوق پستی 111-15655
فقط در مورد خدمات سايت با ما تماس بگيريد. در مورد محتوای اخبار و مطالب منتشر شده در مجلات و روزنامه ها اطلاعی نداريم!
 


توجه:
magiran.com پايگاهی مرجع است که با هدف اطلاع رسانی و دسترسی به همه مجلات کشور توسط بخش خصوصی و به صورت مستقل اداره می شود. همکاری نشريات عضو تنها مشارکت در تکميل و توسعه سايت است و مسئوليت چگونگی ارايه خدمات سايت بر عهده ايشان نمی باشد.



تمامي خدمات پایگاه magiran.com ، حسب مورد داراي مجوزهاي لازم از مراجع مربوطه مي‌باشند و فعاليت‌هاي اين سايت تابع قوانين و مقررات جمهوري اسلامي ايران است