Bioinformatics Analysis of Upstream Region and Protein Structure of Fungal Phytase Gene
Message:
Article Type:
Research/Original Article (دارای رتبه معتبر)
Abstract:
Phytase increases the bioavailability of phytate phosphorus in seed-based animal feeds and reduces the phosphorus pollution of animal waste. Since most animal feeds for pellets are heated up to 65-80 °C, the production of a thermostable structure for phytase can be useful. In this study, we sought to perform bioinformatics analysis of the upstream region and protein structure of fungal phytase to improve its expression and thermostability properties. We used bioinformatics methods such as similarity search, multiple alignment, statistical analysis of physicochemical properties of amino acids, pattern recognition, and protein modeling to find out the effective factors in heat resistance of phytase. Change in Gibbs free energy (ΔG) of the best pattern promoter resulting from the interaction between RNA polymerase and the promoter sequences of modified genes of phytase was equal to -9 kcalmol-1, which is lower compared to other interactions. The evaluation of the three-dimensional structure of new phytases showed that amino acid substitutions aimed at improving thermostability did not change the form and structure of the protein. The results of Prochek, Whatcheck, and ERRAT for structural analysis and verification were 84, 72, and 70, respectively, that were satisfactory.
Language:
English
Published:
Archives of Razi Institute, Volume:73 Issue: 3, Summer 2018
Pages:
229 to 237
magiran.com/p1887441  
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!