شناسایی جدایه های اشرشیا کلی جدا شده از آب سواحل بوشهر با روش PCR

پیام:
نوع مقاله:
مقاله پژوهشی/اصیل (دارای رتبه معتبر)
چکیده:
زمینه
تشخیص با روش های استاندارد نتوانسته است تمام مشکلات تشخیصی اشرشیا کلی را حل نماید. اما با گسترش مطالعات ژنومیک، به نظر می رسد واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) توان کافی برای حل این مشکل را داشته باشد. هدف از این مطالعه تشخیص جدایه های محیطی اشرشیا کلی با کاربرد روش PCR و استفاده از پرایمرهای اختصاصی برای قطعات ژن های lacZ، uidA، cyd و lacY بود.
مواد و روش ها
شناسایی ملکولی اشرشیا کلی با آزمایش های PCR و پرایمرهای چهارگانه فوق بر روی DNA ژنومی تخلیص شده از 120 جدایه محیطی اشرشیا کلی به همراه سویه های استاندارد شیگلا و سویه های انتروهموراژیک اشرشیا کلی به عنوان کنترل انجام شد. کلیه جدایه های محیطی مورد استفاده در یک مطالعه قبلی از آب سواحل بوشهر جداسازی و با روش های استاندارد باکتری شناسی شناسایی شده و سپس جهت مطالعات بعدی در دمای منفی 70 نگهداری شده اند.
یافته ها
پرایمرها قدرت شناسایی اهداف خود را در جدایه های محیطی و سویه های استاندارد داشتند. مشخص گردید به طور هم زمان چهار قطعه مربوط به ژن های lacZ، uidA، cyd و lacY فقط در جدایه ها و سویه های اشرشیا کلی وجود دارند. این روش PCR قدرت جداسازی اشرشیا کلی را از شیگلا، به عنوان نزدیک ترین جنس فیلوژنیک، داشته و برخلاف روش های کلاسیک، توانست سویه انتروهموراژیک را به عنوان اشرشیا کلی تشخیص دهد.
نتیجه گیری
روش PCR طراحی شده برای قطعات ژن های lacZ، uidA، cyd و lacY دقت لازم برای شناسایی و جداسازی اشرشیا کلی از گونه های بسیار مشابه را داشته بنابراین به عنوان یک روش ملکولی قابل اطمینان در تشخیص اشرشیا کلی معرفی می گردد.
زبان:
فارسی
صفحات:
383 تا 392
لینک کوتاه:
magiran.com/p1897840 
دانلود و مطالعه متن این مقاله با یکی از روشهای زیر امکان پذیر است:
اشتراک شخصی
با عضویت و پرداخت آنلاین حق اشتراک یک‌ساله به مبلغ 990,000ريال می‌توانید 70 عنوان مطلب دانلود کنید!
اشتراک سازمانی
به کتابخانه دانشگاه یا محل کار خود پیشنهاد کنید تا اشتراک سازمانی این پایگاه را برای دسترسی نامحدود همه کاربران به متن مطالب تهیه نمایند!
توجه!
  • حق عضویت دریافتی صرف حمایت از نشریات عضو و نگهداری، تکمیل و توسعه مگیران می‌شود.
  • پرداخت حق اشتراک و دانلود مقالات اجازه بازنشر آن در سایر رسانه‌های چاپی و دیجیتال را به کاربر نمی‌دهد.
دسترسی سراسری کاربران دانشگاه پیام نور!
اعضای هیئت علمی و دانشجویان دانشگاه پیام نور در سراسر کشور، در صورت ثبت نام با ایمیل دانشگاهی، تا پایان فروردین ماه 1403 به مقالات سایت دسترسی خواهند داشت!
In order to view content subscription is required

Personal subscription
Subscribe magiran.com for 50 € euros via PayPal and download 70 articles during a year.
Organization subscription
Please contact us to subscribe your university or library for unlimited access!