رویکردی جدید جهت شناسایی و تعیین ارتباط جهش های ژنی mecA بر مبنای HRM با نوع نمونه بالینی در ایزوله های استافیلوکوک اورئوس

جهش ژنی در استافیلوکوک اورئوس از مهم ترین دلایل ایجاد سویه های مقاوم به آنتی بیوتیک است. روش آنالیز منحنی ذوب DNA با قدرت تفکیک بالا (HRM) می تواند این جهش ها را با کیفیت بسیار بالایی شناسایی کند. هدف از این مطالعه، ارزیابی نقش نوع نمونه بالینی در بروز جهش های نوکلئوتیدی در ژن mecA استافیلوکوک اورئوس به روش HRM بود. در این مطالعه تجربی، از 43 ایزوله بالینی استافیلوکوک اورئوس استفاده شد. جهت شناسایی جهش های احتمالی، ایزوله های دارای ژن mecA شناسایی و ژن مربوطه تعیین توالی شد. سپس، تجزیه و تحلیل داده ها با استفاده از نرم افزارهای StepOne v2. 3 و HRM v3. 0. 1 انجام شد. نتایج تعیین توالی به عنوان استاندارد طلایی مورد استفاده قرار گرفت. این مطالعه با کد اخلاق IR. UMSHA. REC. 1396. 637 در کمیته اخلاق پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی همدان به تصویب رسیده است. از 43 ایزوله بالینی استافیلوکوک اورئوس، 11 ایزوله (58/25 درصد) دارای ژن mecA و 32 ایزوله (41/47 درصد) فاقد ژن mecA بودند. با توجه به نمونه های بالینی مختلف، 3 ایزوله (27/27 درصد) مقاوم به متی سیلین از نمونه خون، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه ادرار، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه زخم، 2 ایزوله (18/18 درصد) از نمونه کاتاتر، 1 ایزوله (09/9 درصد) از آبسه و 1 ایزوله (09/9 درصد) هم از سواپ بینی جدا شد. در این بین، ایزوله های گرفته شده از زخم و ادرار دارای بیشترین جهش در اسید آمینه آدنین به صورت A→T، A→G، A→C و A→X مشاهده شد. ایزوله های جدا شده از خون داری جهش در اسید آمینه گوانین به صورت G→A بودند. ارتباط معنی داری بین نوع جهش و نوع نمونه بالینی در ایزوله های استافیلوکوک اورئوس مقاوم به متی سیلین دیده شد.