مطالعه بیوانفورماتیک اعضای خانواده miR-200 و ژن های هدف آن در سرطان پروستات

با توجه به محدودیت های تست تشخیصی رایج سرطان پروستات، معرفی بیومارکرهای با ویژگی بالاتر جهت تشخیص دقیق تر و به هنگام سرطان پروستات مورد توجه می باشد. هدف از انجام این مطالعه، بررسی بیوانفورماتیکی خانواده miR-200 (miR-200a, miR-200b, miR-200c, miR-141, miR-429) و پیش بینی هدف های ژنی این خانواده، جهت بررسی بیشتر تحت عنوان بیوماکر تشخیصی بود. این تحقیق از نوع تئوری و بر پایه بررسی بیوانفورماتیکی میکرو RNA بود که به منظور جستجوی ژن های هدف خانواده miR-200 در مسیرهای سیگنالینگ شناخته شده در پاتوژنز سرطان پروستات از پایگاه DIANA TOLLS-mirPath v.3 استفاده شد. سپس به تایید ژن های معرفی شده توسط ابزارهای پیشگویی کننده آنلاین مانند MiRWalk, Targetscan, RNAhybrid, پرداخته شد. در انتها نقش عملکردی ژن های هدف معرفی شده توسط پایگاه بیوانفورماتیک DAIVID بررسی شد. با توجه به نتایج حاصل از این بررسی ژن E2F3 هدف مشترک تمام اعضای خانواده miR-200 است، BCL2 به عنوان هدف مشترک miR-200b/c/429 و CCNE2 به عنوان هدف مشترک miR-200a/141 بودند. همچنین miR-200c با هدف قرار دادن CDKN1B و miR-429 با هدف قرار دادن KRAS می تواننند در ایجاد سرطان پروستات مداخله کنند. نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که اعضای خانواده miR-200 با هدف قرار دادن ژن های دخیل در پروسه های بیولوژیکی مهم و مسیرهای مولکولی دخیل در پاتوژنز سرطان پروستات احتمالا می توانند تحت عنوان بیومارکر تشخیصی در مطالعات آتی مورد بررسی بیشتر قرار بگیرند.