دکتر محمود احمدی نژاد در پاسخ به درخواست مجتبی ثمره هاشمی، با استعفای وی موافقت کرد. متن کامل این نامه بدین شرح است:

بسمه تعالی

برادر ارجمند جناب ثمره هاشمی

قریب 34 سال دوستی با شما سرمایه گرانبهایی برای اینجانب است. از زحمات صادقانه شما صمیمانه سپاسگزارم و امیدوارم در تصمیم مبارکی که برای خدمت والاتر به انقلاب اسلامی گرفته اید، چون گذشته موفق و سربلند باشید. گفتنی است، سیدمجتبی ثمره هاشمی چندی پیش استعفای خود از مشاورت عالی رئیس جمهوری را در پی تصمیم اش برای حضور در فعالیت های مردمی انتخاباتی در حمایت از دکتر احمدی نژاد تقدیم رئیس قوه مجریه کرده بود.